1. 柱平衡步骤:向吸附柱CP4 中(吸附柱放入收集管中)加入500 µL的平衡液BL, 12000 rpm(~13400g)离心1 min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。(请使用当天处理过的柱子) 2. 取5-15ml 过夜培养的菌液加入离心管中,12000 rpm (~13400g )离心1 min,尽量吸除上清。
注意:菌液较多时可以通过几次离心将菌体沉淀收集到一个离心管中,菌体量以能够充分裂解为佳,过多的菌体裂解不充分会降低质粒的提取效率。
3. 向留有菌体沉淀的离心管中加入500 µL溶液Pl (请先检查是否已加入RNaseA ) ,使用移液器或涡旋振荡器*悬浮细菌细胞沉淀。
注意:请务必*悬浮细菌沉淀,如果有未*混匀的菌块会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。质粒
4. 向离心管中加入500µL溶液P2 ,温和地上下翻转6-8 次使菌体充分裂解。
注意:温和地混合不要剧烈震荡,以免污染基因组DNA 。此时菌液应变得清亮粘稠,所用时间不应超过5 min,以免质粒受到破坏。如果未变得清亮,可能由于菌体过多,裂解不*,应减少菌体量。
5. 向离心管中加入700 µL溶液P3 ,立即温和地上下翻转6-8 次,充分混匀,此时会出现白色絮状沉淀。12000rpm ( ~13400g )离心10 min,此时在离心管底部形成沉淀。 注意:P3 加入后应立即混合,避免产生局部沉淀。如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清。
6. 将上一步收集的上清液分次加入过滤柱Cs (过滤柱放入收集管中), 12000rpm(~13400g )离心2 min,小心地将离心后收集管中得到的溶液分次加入吸附柱CP4 中(吸附柱放入收集管中), (如果过滤柱中有残余的液体说明步骤5 吸取的上清中杂质过多,可以延长离心的时间;如果离心后收集管底部有少量的沉淀.尽量地吸取上清)。
7. 12000rpm (~13400g)离心l min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP4 放入收集管中。
8. 向吸附柱CP4 中加入500µL去蛋白液PD,12000rpm(~13400g)离心l min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP4 放入收集管中。
9. 向吸附柱CP4 中加入600µL漂洗液PW(请先检查是否已加入无水乙醇),12000rpm(~13400g)离心1 min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP4 放入收集管中。注意:加入漂洗液PW后,如果室温静置2-5 min,有助于更好地去除杂质。
10. 向吸附柱CP4 中加入600μL漂洗液PW , 12000rpm(13400g)离心l min,倒掉收集管中的废液。
11. 将吸附柱CP4 重新放回收集管中置于12000rpm(~13400g )离心2 min,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除。 注意:漂洗液中乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR 等)实验。为确保下游实验不受残留乙醇的影响,建议将吸附柱CP4 开盖,置于室温放置数min,以*晾干吸附材料中残余的漂洗液。
12. 将吸附柱自科置于一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加100-300µL洗脱缓冲液TB ,室温放置2 min,12000rpm(~13400g )离心l min将质粒溶液收集到离心管中。
注意:为了增加质粒的回收效率,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中.重复步骤12 。洗脱液的pH 值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液,应保证其pH 值在7.0-8.5 范围内(可以用NaOH 将水的pH 值调到此范围), pH 值低于7.0 会降低洗脱效率。洗脱缓冲液体积不应少于100µL,体积过小影响回收效率。且DNA产物应保存在-20 ℃ ,以防DNA 降解。
质粒DNA 浓度及纯度检测:
得到的质粒DNA 可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。电泳可能为单一条带,也可能为2到3条DNA 条带,这主要与提取物培养时间长短、提取时操作剧烈程度等有关。 OD260值为 l 相当于大约 50µg/ml 双链 DNA 。 OD260 / 0D28 。比值应为 1.7 -1.9 ,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用去离子水,比值会偏低,但并不表示纯度低,因为 pH 值和离子存在会影响光吸收值。