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线虫unc-22突变基因的克隆

上海沪宇生物科技有限公司

2013/6/13 9:32:14

 

线虫unc-22突变基因的克隆
实验原理
外源DNA与载体分子的连接就是DN重组,这样重新组合的DNA叫做重组体或重组子。重组的DNA分子是在DNA 连接酶的作用下,有Mg2 、ATP存在的连接缓冲系统中,将载体分子与外源DNA分子进行连接。Taq DNA聚合酶扩增的PCR产物,其DNA双链前后末端都有一个游离的A碱基,可以与pMD18-T Vector 末端游离的T碱基互补形成环状重组T质粒。将携带目的基因的T质粒转入大肠杆菌并对其进行蓝白斑筛选鉴定,挑选出所需的重组质粒。
实验试剂
1. Taq DNA聚合酶
2. 安苄青霉素
3. 葡萄糖
4. X-gal
5. IPTG
6. pMD18-T载体
7. LB培养基
8. 溶液I、溶液II、溶液III
9. 苯酚
10. 三氯甲烷
11. 95%乙醇
12. 无水乙醇
13. RNAase A
14. DNA Marker
实验设备
1. 培养皿
2. 涂玻棒
3. 移液枪
4. 枪头
5. 1.5ml离心管
6. PCR
7. PCR
8. 恒温培养箱
9. 恒温摇床
10. 恒温水浴锅
11. 离心机
12. 无菌操作台
实验步骤
1. 引物设计
从NCBI上下载线虫unc-22基因序列(GenBank登录号:NM_069873),依照此序列用 Primer 5.0软件分别设计上游和下游扩增引物。
2. 目的基因的PCR扩增
25µl反应体系:
模板cDNA 1.5µl
10×reaction buffer 2.5µl
2.5mM MgCl2 2µl
2.5mM dNTP 2µl
上游引物 1µl
下游引物 1µl
Taq DNA聚合酶 0.2µl
加ddH2O至总体积 25µl
按照以下程序进行PCR扩增:
94℃预变性4min;
94℃变性40s,56℃退火40s,72℃延伸1min,共30个循环;
72℃总延伸10min,4℃保存。
取5µl PCR产物与荧光染料混合均匀在1%琼脂糖凝胶电泳(1×TAE电泳缓冲液、100V恒压),用凝胶成像系统照相观察,确定所得DNA的大小和纯度。
3. 目的基因片段PCR产物的纯化回收
将PCR产物与荧光染料混合均匀进行1%琼脂糖凝胶电泳,在凝胶成像系统下用干净刀片切下含目的基因片段的胶带。按照DNA快速纯化/回收试剂盒操作说明,纯化回收目的片段。
4. 目的基因片段与克隆载体的连接
PCR产物经试剂盒纯化回收后,通过T/A克隆的方法,直接与pMD18-T载体连接,连接反应体系如下:
纯化回收的PCR产物 4μl
Ligation SolutionⅠ 5μl
pMD18-T Vector DNA 1μl
混匀后16℃连接过夜。产物可于-20℃保存。
 

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