随着现代科学技术的发展，徕卡荧光显微镜结构在不断地完善，功能多、外观造型美的仪器在不断地推出，目前徕卡荧光显微镜的主要结构由以下三个方面组成。
1徕卡荧光显微镜的透射光系统
本系统大体可分为光源部分、仪器主体部分及镜头。
（1）徕卡荧光显微镜光源部分包括石英汞灯石英质外壳内充填超高压或高压汞气的灯管。消球差透镜。通过该透镜可使由光源来激励滤光片。为了滤掉由灯管的光线形成清晰而平行的光束。所发出的其它非紫外光部分，选用光谱波长为365nm的紫外光滤光片，使光源成为紫外光源。
（2）徕卡荧光显微镜仪器主体部分与生物显微镜构造基本相同，具有台下棱镜、台下聚光镜及载物台等，先进的还具有偏光装置。
（3）徕卡荧光显微镜仪器的物镜及目镜镜头具有一套显微目镜和显微物镜系统它是在可见光通过与发荧光物体的光程范围内的条件下进行肉眼观察和在紫外线透射光下照相用的，常配有石英萤石物镜、玻璃透镜、消色差物镜等。
（4）徕卡荧光显微镜抑制滤光片为了保护观察者的眼睛，在进入目镜的光路前安上波长在436nm以上的滤光片，它几乎*吸收了波长短于365nm的紫外光线。
透射光系统由光源产生紫外光，经仪器的主体（台下折光棱镜及聚光镜）透射到载物台的岩石薄片上再经物镜、目镜直接投射到观察者的眼睛中。
该系统是用来观察岩石薄片中所含烃类物质的各个组分（除不发光的烷烃外）。
2徕卡荧光显微镜的反射光系统
它的光源系统与透射光系统相同，不同的是它不通过台下折光棱镜和聚光镜，而直接将荧光发生器安装在显微镜基座上。这样由光源来的光改变了原光路系统，使紫外光先经过物镜上端，通过物镜照射到载片的物体或岩石磨光面上将激发的荧光反射回物镜经目镜到达观察者的眼睛。
反射光系统所观察到的光线是岩石表面能被紫外光激发而产生的荧光。由于轻质沥青易逸散往往浮在岩石表面，所以用反射光来观察薄片及岩石磨光面的轻质沥青物质以及煤层、天然沥青、裂缝中的沥青物质等。
3徕卡荧光显微镜的照相系统
照相系统是用来拍摄对镜下观察到的代表性或典型性内容以充实文字描述的再现性增添的一项辅助系统，目前该系统的功能多为自动化，它主要包括电子测光装置、变倍镜头、照相机和控制盘，照相机一般都装置在仪器主体的顶端，由电缆连接控制台，操作极为方便。
备注：徕卡荧光显微镜的结构特征的部分文章由北京中仪光科科技有限公司编辑整理上传。
