磁力加热搅拌器控温方式普遍有两种，一种是用电接点水银温度计控温，另一种是采用传感器(电热偶)控温.
磁力加热搅拌器在使用过程中电接点水银和传感器一端都是要放入到测量的液体中，另一端与机器连接，在控温过程中，当液体温度低于设定温度，加热盘开始加热，当液体温度达到所设定的温度，这时由电接点水银温度计或传感器传输信号到磁力搅拌器主机，此时加热盘停止加热，当温度再次低于设定温度时，加热盘继续加热，这就是磁力加热搅拌器控温的原理。
在使用磁力加热搅拌器要注意两点：
*，加热盘有热惯性，控温时有可能高于设定温度，如果实验要求比较高，此时要注意控制加热盘的温度(即加热电压)。
第二，采用电接点水银温度计控温时是在电接点水银温度计上面设定温度，采用传感器控温方法是在机器主机上设定温度。由此看出，传感器控温更加方便。但是传感器采用金属材料，所以耐腐蚀程度没有电接点水银温度计玻璃的好。
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