工具显微镜是很精密的测量仪器，如果保养的不好，将会很大程度的降低使用寿命和精度。工具显微镜在不用时，用塑料袋包起来，然后在塑料带里放1~2包干燥剂，显微镜放到通风的环境下，物镜镜头要定期擦。
1、工具显微镜能放置在清洁干净的场所，但一般在机械工厂使用的机会很多，所以要注意下面问题：
（1）一般照明不要超过必要的亮度；
（2）不会沾油污的地方；
（3）灰尘少的地方；
（4）振动少的场所；
（5）不会发生温度急剧变化的地点。
2、玻璃零组件：
玻璃零件应随时保持清洁，不可沾上污垢，否则生像不清晰而且降低测定精度。
（1）镜头：平时注意不要用手触碰镜头，假若镜头表面沾有手纹或油污，可用镜头清洁剂或者纱布浸湿酒精轻轻擦拭，些微的灰尘是不会影响测定效果的。
（2）测量台座玻璃：放置测定物时zui容易伤及测量台座的玻璃面，所以要特别注意。若沾上油垢或灰尘用柔软拭布擦拭。对物透镜及观测透镜的使用也要十分注意。当从显微镜拆卸观测透镜时容易使显微镜的活动焦距沾上灰尘，所以如果不使用也要把观测透镜装在显微镜上。
3、电气零件：
工具显微镜必须使用较高压的电流，如果接触不良容易产生热，会发生危险，所以必须随时检查，原则上主机必须接地。
4、消耗品及附件：
灯泡及电源保险丝属于消耗品，购置时应准备备品以便更换。附件则以测定台玻璃zui重要，也须准备备品。
