生物安全柜中，HEPA过滤网有足够的纤维使得10,000个微粒物中zui多只允许3个以下0.3微米的微粒物通过，即捕捉率高达99.995%。任何微粒物 如果它在空气中，HEPA过滤网将会一视同仁的捕捉它，这些包括家庭灰尘、纤维、香烟烟雾、动物毛发、植物花粉、细菌、微菌及其他病毒、菌体。
细菌和病毒无法生存于没有水份的环境下，大部分玄浮于空气中的污染微粒物含有少量的水份这将提供细菌和病毒所赖以维生的物质。一旦玄浮微粒物与细菌、病毒同 被HEPA滤心所捕获，HEPA细密的纤维会将之紧紧包覆，其水份很快地被蒸发，水份供应中断，被捕获的细菌、病毒便无法存活。
生物安全柜的HEPA过滤网可用于对空气品质要求严格的场所，提供清净的工作环境。这些场所如制造、光纤生产、化学分析、组织培养、医药生产、DNA、癌症和其他生物研究、 病人隔离、底片制造及加工过程、磁碟制造、原子研究、外科手术。另HEPA空气清净机对空气中过敏原微粒物之高滤净效能，被证实能有效降低过敏及气喘发病率。
