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BioMark MPIDA 多色全景成像数据分析服务
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多玛克科技(北京)有限公司本着“探索生命色彩 构建多维视野”的公司愿景,以“立足科研 服务诊疗”为使命,以染色及分析为核心技术,面向科研及医疗诊断用户提供优质、精准的多重免疫荧光染色及原为表型分析服务。
目前在北京拥有独立的商业化实验室平台,具有样品存储、制样、切片、分子病理、免疫组化、数字成像及数据定量分析等实验条件,具备一整套标准化实验室日常操作管理流程。多玛克引进科研级自动化病理处理及分析设备,制定严格的实验室SOP标准,可以减少人为操作带来的误差,更好的保证实验操作的一致性,提高实验结果的准确性和重复性,全力保证染色的质量,为每一例样本保驾护航。 同时采用的分析手段,将大数据立体化呈现给广大科研、医疗工作者,使实验数据限度得到充分的利用,协助您探索生命的奥秘。
多色全景成像数据分析服务
多重免疫荧光的数据层分析技术,可在亚细胞、单细胞、多细胞组织结构、细胞空间分布等不同水平同时对目标数据量化:
1.亚细胞:统计分子探针标记(FISH、ISH、RNAscope等)的数量、荧光强度、识别亚细胞水平结构标记物如细胞器、细胞骨架等;
2.单细胞:准确识别单个细胞的细胞核、细胞质、细胞膜染色区域,提供面积、染色强度、数量及多种形态学数据,包括总细胞计数、阳性细胞的计数、平均强度、百分比等;
3.组织结构:基于AI自学习实现特殊组织类型的识别,如腺体、肿瘤、血管、支气管、肌肉、骨等,统计特异性组织结构数量、面积、染色强度、百分比等;
空间分布:特定组织或结构分层划分实现组织微环境的细化分析,提供组织-组织,细胞-细胞,细胞-组织间的形态分布及蛋白表达关系的大数据。
优势:
1.多重免疫荧光分析,可做到9标10色。
2.单细胞精准识别,可将聚集细胞清楚分开识别
3.阳性信号的识别,识别有效的细胞质形态,
4.正反向回溯来反复校验单细胞和阳性信号识别的准确性
5.可做到微米级别精度对微环境中免疫细胞的量化分析,任意设置区域
6.可以做细胞社会学,通过细胞位置分布探索功能作用,反应同类细胞的相互距离与聚集程度
1.染色
酪酰胺信号放大(TSA,Tyramide signal amplification)技术是一类利用辣根过氧化酶(HRP)对靶蛋白进行标记的酶学检测方法,类似常规免疫组化的DAB显色方法 ,TSA技术同样采用HRP标记的二抗,同样有对应的“显色”步骤(HRP催化加入反应体系的酪胺荧光素底物,产生活化荧光底物,活化底物可与抗原上共价结合,使样品上稳定的共价结合酪胺荧光素。之后用热修复法洗去非共价结合的一抗-二抗-HRP复合物,重复下一种一抗-hrp二抗来第二轮孵育,换另一种酪胺荧光素底物,如此往复就可实现多重标记。目前本公司可以实现9标10色
2.扫描
搭载TissueFAXS Spectra 全自动多标记成像系统,作为细胞和颜色通道染色强度定量工具,在低倍数预览扫描后,样本会被自动或用户定义地识别,并自动扫描!与传统玻片扫描仪不同,TissueFAXS允许您使用多个物镜和分辨率(最多7种),而不只是同一分辨率下的数字放大。甚至可以使用100x油浸物镜!
显微镜自动化,支持自动化工作流程!通过逐个视野获取图像,对于荧光样本还支持逐个通道获取,系统会生成大型概览图像,随后进行复杂的图像分析!系统始终需要核染色,因为我们利用来自细胞核的信息来定位每个单独细胞、其细胞核和细胞质!数据输出类似于流式细胞术,包括图表和详细的统计数据。
全景多光谱成像设备:TissueFAXS Spectra 全自动多标记成像系统
3.数据分析
专业的数据分析人员与SQ数据分析软件紧密合作,可以为客户提供高度标准化和定制化的数据分析服务。这些服务能够满足客户在多种维度上的需求,包括图像呈现、细胞定量、空间分析以及大数据挖掘等。
通过结合专业知识和技术工具,分析人员可以为客户生成精确且有意义的数据解读。这种协作不仅提高了数据处理的效率和质量,还能够根据客户的特定需求定制分析流程,从而提供更具针对性的解决方案。这种灵活性和高效性使得数据分析能够更好地支持客户的决策与研究目标。
基础分析:
识别细胞核:
识别marker:
正反向回溯:
双阳、多阳、阴阳组合:
高阶分析:以组织为中心
classifier识别TUMOR:
classifier识别TLS:
classifier识别TUMOR区有效细胞核:
TUMOR区CD68+ -组织内外细胞统计:
TLS外扩30/70μmCD68-组织外环状区域细胞统计:
距离TLS 0-30μm环状区域
距离TLS 30-70μm环状区域
CD68+信号展示
高阶分析:以细胞为中心
距细胞一定范围内另一类细胞统计:
细胞自聚集:统计线段数量
聚集指数=线段数量/阳性细胞数
细胞间连线:
高阶分析之组织与组织、细胞与细胞进行组合分析:
黄色区域为TLS外0-30μm环状区域
灰色区域为TLS外30-70μm环状区域
环状区域内阳性细胞数据均可统计(示意中为TLS外30-70μm区域内CD68阳性细胞10μm范围内自聚集连线)
分析结果:将以数据分析报告形式展示