Real-titer慢病毒滴度测定(Q-PCR)试剂盒
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生产厂家关于我们:
上海乐赛生物科技有限公司是一家专业从事生命科学科研和生产高品质试剂和耗材的研发、生产及销售的企业。由多位深耕于专业多年的精英团队创立,核心成员拥有丰富的从研发到市场的经验,帮助我们为客户提供更优质可靠的国产化产品和更灵活高效的服务。
我们的愿景是:
面向国内,走向国际,成为细胞类试剂和耗材的中国制造先头梯队。
我们的使命是:
通过提供优质细胞培养类产品,满足科研和生产对于产品高品质、快捷性和成本可靠的需求。
本试剂盒能够快速、简便、高效地对基于HIV-1构建的慢病毒进行有效滴度测定。通过对感染慢病毒的细胞基因组DNA中整合的慢病毒插入片段拷贝数进行Q-PCR测定,计算出初始病毒的有效滴度。
产品特点
►本产品采用感染病毒后靶细胞基因组作为模板,测得数据更真实
►基于Taqman探针法开发本产品,结果更准确
►适用于所有基于HIV-1病毒构建的慢病毒滴度测定
产品成分
试剂名称 | 内容 | 数量 |
Solution 1 | 标准品DNA模板(5x10^9 c/μl) | 100μl |
Solution 2 | Lenti-primer (10μM) | 40μl |
Solution 3 | Lenti-probe –FAM/TAMRA(2.5μM) | 80μl |
Solution 4 | Taq (probe qPCR) (2X) | 1ml |
Solution 5 | ROXI(50X) | 40μl |
Solution 6 | ROX II(50X) | 80μl |
其他所需材料
细胞基因组DNA抽提试剂(离心柱法)
超纯水
Q-PCR用96孔板或8连管
定量PCR仪
1.5ml无酶离心管用于样品制备
无酶枪尖
Real-titer慢病毒滴度测定(Q-PCR)试剂盒
操作步骤
1.取感染72h后的293T细胞,胰酶消化制备单细胞悬液,细胞计数,得细胞数为N;
2.利用细胞基因组抽提试剂盒提取293T细胞基因组DNA,测定基因组DNA总量为G (μg),稀释至50ng/μl备用;
注:此步骤推荐使用分离柱式基因组抽提试剂盒3.根据下表稀释标准品及基因组DNA样品:
标准品管 | 样品管 | ||||||
# | 稀释倍数 | Water | 标准品 | 拷贝数/μl | 稀释倍数 | Water | 样品(50ng/μl) |
1 | 10^1 | 45μl | 5μl | 5.45x10^8 | 10 | 45μl | 5μl |
2 | 10^2 | 45μl | 5μl of 1# | 5.45x10^7 | 50 | 40μl | 10μl of #1 |
3 | 10^3 | 45μl | 5μl of 2# | 5.45x10^6 | 100 | 45 | 5μl of #1 |
4 | 10^4 | 45μl | 5μl of 3# | 5.45x10^5 | |||
5 | 10^5 | 45μl | 5μl of 4# | 5.45x10^4 | |||
6 | 10^6 | 45μl | 5μl of 5# | 5.45x10^3 |
梯度稀释取样前,需充分混匀;
4.根据下表配制反应液,每组配制3个复孔:
试剂 | 用量 | 终浓度 |
标准品或样本 | 2μl | *1 |
Lenti-primer (10μM) | 0.4μl | 0.2μM |
Lenti-probe (2.5μM) | 0.8μl | 0.1μM |
Taq (probe qPCR) (2X) | 10μl | 1X |
ROX | *2 | |
Water | 补至20μl |
*1:样本除步骤3中稀释的3种浓度外,另需一组未稀释样本,即总量为100ng/孔;另需设置阴性对照孔,即不添加任何DNA模板;
*2:根据所使用仪器添加:
适用仪器 | |
ROX I (终浓度1X) | 7300 Real-Time PCR System/ StepOnePlus Real-Time PCR System |
ROX II (终浓度0.5X) | 7500 Real-Time PCR System/7500 Fast Real-Time PCR System |
无需ROX | Thermal Cycler Dice Real Time System series/ LightCycler 480 System/ CFX96 Real-Time PCR Detection System |
5.上机,按照以下程序进行Q-PCR反应:
变性 (1 Cycle):95℃ 30s
扩增 (40 cycles):95℃ 5s + 60℃ 30
注:可根据具体使用仪器自行调整程序。6.计算标准曲线:计算每组标准品的平均Ct值,以平均Ct值为X,Loge(copy number)为Y,生成标准曲线Y=A*Ct+B。标准曲线R2需大于0.99;
7.计算样本平均Ct值,带入标准曲线计算出copy number=n。
注:以Ct值在标准曲线范围内的数据为准,若样本Ct值超过或低于标准曲线Ct值,需对样本稀释倍数进行相应调整。8.计算病毒滴度:举例
Titer(TU/ml)=[n*d*(G/0.1)/N]*Nori/V
其中:n=步骤7中计算所得拷贝数;d=所用Ct值对应的稀释倍数(1, 10, 50, 100);G=基因组提取所得DNA总量(μg);N=基因组提取所用细胞数;Nori=病毒感染时细胞数;V=病毒感染时病毒用量(ml)。
计算各个Ct值位于标准曲线范围内的不同稀释倍数组病毒滴度,取平均值为最终结果。