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Chromium Controller 单细胞测序仪
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经销商斑马鱼(北京)科技有限公司,是实验室整体解决方案的专家,专注于为生命科学、医学研究、药物研发、食品安全、环境分析等领域提供实验室仪器设备和试剂。
同时我们也有专业的实验室,提供单细胞测序、空间转录组、Olink多重细胞因子检测、外泌体表征、定制化生物信息分析等实验技术服务。
公司主要服务于国家的重点高校和医院建设,重大科学研究和试验发展项目,以及国内外企业的研发机构。主要客户包括清华大学、北京大学、南开大学、郑州大学、哈尔滨工业大学、兰州大学、西安交通大学、中科院、中国医科院、中国农科院、军科院、协和医院、阜外医院、天坛医院、301医院、北大附属医院等。
公司积极参与相关领域的学术会议,并定期举办相关仪器设备的技术讲座和培训班,在科研和检测领域产生了积极的反响,获得了良好的口碑。
公司总部设在北京市朝阳区鸟巢附近,在西安、郑州、哈尔滨等地设有办事处。拥有业内经验丰富的管理团队和高素质的销售技术队伍,能够为客户提供专业的一站式实验方案,及时解决实验和仪器使用中的疑难问题。
公司合作的部分品牌包括:
美国安捷伦:流式细胞仪、BioTek酶标仪、细胞成像微孔板检测仪、Seahorse细胞能量代谢分析仪、xCELLigence RTCA实时无标记细胞分析系统;
美国10x Genomics:单细胞测序、空间转录组、组织空间原位多组学分析;
瑞典Olink:高灵敏多重微量的细胞因子及蛋白标志物分析系统;
美国TA仪器(沃特世公司):ITC等温滴定微量热仪、DSC差示扫描微量热仪;
德国Merck Millipore:微流控细胞芯片分析仪、单分子免疫检测平台;
美国PerkinElmer:小动物活体成像、酶标仪、高内涵成像;
瑞士罗氏诊断:荧光定量PCR、数字PCR、核酸提取系统;
日本基恩士:多功能超景深显微成像系统;
美国ProteinSimple:全自动Western Blot、细胞因子分析系统;
德国Particle Metrix:NTA纳米颗粒跟踪分析仪(外泌体表征);
荷兰Metris:小动物笼内精细行为检测分析系统、小动物超声波发声检测分析系统;
德国Cultex:动物多功能暴露染毒系统,细胞暴露染毒系统;
以服务生命科学领域科研事业为己任,以为客户提供优质的完整的实验室解决方案为使命,以客户为中心,以专业人才为保障,为客户提供专业的长期的优良服务。更多信息欢迎和我们联系。
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一、仪器简介:
(1)单细胞测序仪器设备Chromium Controller,是一款小巧的单细胞建库解码系统,可放置在标准实验工作台上。能够在十几分钟内高效地自动化生成大于10万个含有条形码的纳升级分区,从而实现高度并行的样品分液和添加分子标签。
(2)一次处理多达8个样品,每个样本可分析100-10000个细胞。结合Cell Ranger数据分析软件和Loupe Browser可视化软件,轻松实现单细胞水平转录组、免疫分析、基因组拷贝数变异和染色质开放性等研究。品牌10x Genomics,型号GCG-SR-1,产地新加坡,代理商是斑马鱼(北京)科技有限公司。
二、为何选择10X单细胞测序?
(1)细胞异质性是造成生物复杂性的一个关键因素,但往往被群体细胞分析技术——比如RNA测序(RNA-seq)或芯片分析等所掩盖。
(2)单细胞测序技术并非提供平均数据来显示细胞如何工作,而是让研究人员能够更全面地鉴定组织异质性、识别稀有细胞类型,并逐个细胞地解析分子机制。这种高分辨率能带来突破性的成果,4000多篇采用10x Genomics公司技术的文献便是很好的证明。
三、单细胞测序仪工作流程:
单细胞测序流程是从单细胞或细胞核悬液开始的。采用*进的微流体技术生成含有单细胞或细胞核的微滴。接着按照简化的流程来构建文库。测序后采用整合的数据分析流程和可视化软件来处理和分析数据——此软件对新用户来说足够直观,对专家来说又足够强大。
四、技术原理:
Chromium单细胞解决方案能够从多个角度捕获细胞活性的分子读数,包括基因表达、染色质可接近性、细胞表面蛋白、免疫克隆型、抗原特异性以及CRISPR编辑。这项技术的核心之处在于能够产生成千上万个单细胞微滴,而每个微滴都含有一个可识别的条形码,便于下游分析。
五、Next GEM技术:
①每个Chromium解决方案都从高度多样化的凝胶珠(GelBeads)开始,每个凝胶珠都带有的寡核苷酸条形码标签序列,以及便于捕获目标分子的功能化序列。
②在Chromium系统内,将带有条形码标签的凝胶珠与细胞或细胞核、酶以及分液油混合,产生成千上万个单细胞乳液微滴,这些微滴被称为“GEM”(Gel Bead-in-emulsion)。
③每个GEM都作为单独的反应微滴,凝胶珠在其中溶解,捕获每个细胞的目标分子,添加条形码并扩增。
④添加条形码后,来自同一细胞或细胞核的所有片段都共享一种10x 条形码。将成千上万个细胞的带有条形码的产物混合,进行下游反应,从而产生与短读长测序仪兼容的文库。
⑤在测序后,生物信息学工具将利用可识别的条形码序列将测序片段定位到原本的单细胞或细胞核。
六、一个系统可实现多种单细胞应用:
1. 单细胞基因表达:以单细胞分辨率对数百个至数万个细胞进行全面的3’或5’转录组测序,从而鉴定细胞异质性,探索发育和疾病背后的机制,并追踪细胞谱系。
2. 单细胞免疫分析:能够在单细胞基础上对数万个T细胞和B细胞的全长配对受体测序和基因表达谱分析,分析免疫细胞组库,确定B细胞和T细胞的抗原特异性,表征组织微环境,超越传统的流式细胞术。
3. 单细胞表观基因组分析:染色质转座酶可接近性分析(ATAC),实现数万个单细胞核的表观基因组分析,定义细胞类型和细胞状态,收录细胞类型特异性的调控因子,鉴定重要的转录因子,绘制基因调控网络。
4. 单细胞蛋白表达:全面分析细胞类型和表型,验证单细胞RNA-seq的结果,并阐明细胞信号通路,有助于探索分子机制或改变药物发现。
5. 单细胞多组学ATAC + 基因表达解决方案:同时分析数万个细胞的同一细胞内基因表达和开放染色质,关联调控元件和目标基因,表征细胞异质性,发现新的基因调控相互作用,鉴定罕见的细胞类型。
七、技术培训和支持:Xenium、Visium CytAssist、Chromium Connect,Chromium X、Chromium™ Next GEM Single Cell 3' GEM, Library & Gel Bead Kit、Visium Spatial for FFPE Gene Expression Kit、Chip G、Feature Barcode Library Kit……斑马鱼(北京)科技有限公司是10x Genomics代理商,负责销售仪器和试剂,具备丰富的单细胞测序和空间转录组实验方面经验,可为用户提供单细胞悬液制备,建库,测序,生信分析等一整套解决方案。在购买仪器后,将安排有资质的工程师进行现场安装和培训。培训内容包括样本制备、仪器操作、数据分析。在培训完成后,客户还将获得支持,包括远程技术支持(Technical Support)、现场应用科学家(FAS)、现场服务工程师(FSE)和生物信息学应用(Applied Bioinformatics)团队,覆盖实验工作流程、试剂耗材、仪器和软件的各个方面。
八、仪器技术参数:
1、功能用途:通过对数千上万个细胞的独立分封,逆转录,添加标签序列,建库,实现对每个细胞的cDNA添加标签并建库。系统兼容单细胞3’表达谱测序,单细胞5’表达谱测序,单细胞VDJ全长测序,单细胞CNV测序和单细胞ATAC测序。
2、系统可以产生不少于50万个独立的液滴反应体系;
3、提供至少300万种序列标签标记每个细胞的转录组;
4、分析细胞数量:每个样本可分析100-10000个细胞;
5、细胞捕获效率:可达65%以上;
6、可同时检测来自同一细胞的 mRNA 和细胞表面蛋白;
7、可靶向检测人泛癌、免疫相关、特征性基因等,每种panel 已验证基因数超过 1000 个;
8、针对单细胞 V(D)J 分析,可获得单个 T 细胞 TCR 的α链和β链的配对序列信息;
9、针对单细胞 V(D)J 分析,可获得单个B细胞 BCR的重链和轻链的配对序列信息;
10、针对单细胞 ATAC 分析,线粒体污染率低于 2%;
11、针对单细胞多组学ATAC+基因表达分析,可同时检测来自同一细胞的mRNA和染色质可及性;
12、通量:一次可处理样本数量不少于8个;
13、提供序列完整单细胞分析软件系统;
14、仪器大小尺寸:20 x 26.3 x 16.4 cm;
15、重量:5.6公斤。
七、斑马鱼(北京)科技有限公司,是10x Genomics公司的授权经销商,负责产品的推广销售和技术支持,为您提供技术参数,报价、选型、实验指导、安装培训、售后服务等,更多信息可和我们联系。