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二代测序

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上海翼和应用生物技术有限公司

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目标区间重测序

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DNA甲基化测序

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主要技术服务:细胞STR鉴定;支原体检测;细胞种属检测;端粒长度检测;端粒酶活性检测等。

上海翼和应用生物技术有限公司至今已有十八年历史。公司具备ISO9001与CMA资质,上海翼和专家团队富有开创精神,朝气蓬勃,秉承“专业、协作、进取”的企业精神,为国内科研工作者和生物医药企业提供细胞质控类、健康检测类与科研技术类的服务与产品。

翼和专注为工业客户提供:细胞STR鉴定,种属鉴定,PDX模型质控,支原体检测服务/试剂盒,端粒长度检测/试剂盒,端粒酶活性检测/试剂盒等服务及产品。为科研客户提供:实验大小鼠遗传背景鉴定,线粒体拷贝数变异检测,超高重SNP分型检测,目标区间重测序,目标区域甲基化测序等服务。

 

 

 

详细信息

二代测序介绍:

表观遗传学(epigenetics)是目前分子生物学研究的热点之一,DNA甲基化测序是表观遗传学的重要内容,是基因组DNA的主要表观遗传修饰形式之一。DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶(DNMTs)的催化下,将甲基基团转移到胞嘧啶碱基上的一种修饰方式。它主要发生在富含双核苷酸CpG岛的区域。正常情况下CpG岛是以非甲基化形式(活跃形式)存在的,DNA甲基化可导致基因表达沉默。DNMTs的活性异常与疾病有密切的关系。对于维持正常细胞功能、传递基因组遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生,起着至关重要的作用。

上海翼和生物通过亚硫酸氢盐(bisulfite)处理,用多重PCR扩增目的片段,添加barcode和测序通用接头,在Illumina X10二代测序平台对PCR产物进行高通量测序,利用生物信息学方法,精确定量计算目标区间内的甲基化位点的甲基化状态,在完成目标区域检测的同时大幅降低研究费用。

Hi-MethylSeq结合了亚硫酸盐转换、靶向扩增子高通量测序技术,可实现多区段、多位点的甲基化精确定量分析。本方法适用于感兴趣的目的片段的甲基化研究,在大样本中进一步确认全基因组甲基化研究挑选的阳性位点。

重亚硫酸盐处理是DNA甲基化测序中基因组DNA处理的金标准,是一个化学过程,可造成DNA的损伤,很难同时实现100%的转换效率和保持DNA的完整性,二者需要做出一定的平衡。Hi-MethylSeq目标区域之外选取3段非CpG岛序列作为内对照,准确评估样本的转化率。

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