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miRNA高通量测序实验服务
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生产厂家上海达为科生物科技有限公司,位于上海长江软件园,公司目前具备较好的生物学、医学技术服务平台,能够为广大客户提供医学科研样本检测、合作研究、开发及生产服务。
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miRNA高通量测序实验服务
miRNA高通量测序(miRNA-seq)是一种用于检测和定量微小RNA(miRNA)表达谱的高通量测序技术。miRNA是一类非编码RNA,长度约为18-25个核苷酸,它们在基因表达调控中发挥着重要作用,尤其是在转录后水平上通过与靶mRNA的3'非翻译区(3' UTR)结合来抑制其表达。miRNA-seq技术能够揭示已知miRNA的表达模式,同时也能够发现新的miRNA分子。
miRNA高通量测序实验服务流程
miRNA高通量测序的实验流程通常包括以下几个步骤:
1.样本准备:提取总RNA,并通过特定的纯化步骤富集miRNA。
2.构建文库:使用适配体连接到miRNA的3'和5'末端,然后通过逆转录和PCR扩增构建测序文库。
3.高通量测序:将文库装载到测序平台上进行测序,常用的测序平台包括Illumina、HiSeq等。
4.数据处理:测序产生的原始读段(reads)经过质量控制、修剪接头等预处理步骤,然后比对到参考基因组上。
5.数据分析:通过专门的生物信息学工具和算法分析比对结果,鉴定已知miRNA并预测新的miRNA分子,同时进行表达量的定量分析。
miRNA高通量测序的应用领域
miRNA高通量测序技术在生物医学研究中有着广泛的应用,包括:
1.疾病机理研究:通过比较疾病组织和正常组织中的miRNA表达谱,揭示疾病的分子机制。
2.生物标志物发现:miRNA作为生物标志物在疾病的早期诊断、预后评估和治疗响应监测中具有潜在价值。
3.药物开发:了解miRNA在药物作用中的角色,指导新药的研发。
最新研究进展
根据最新的研究,miRNA高通量测序技术不断进步,研究者们正在开发更加高效和精确的分析工具。例如,有研究团队开发了MyBrain-Seq管道,这是一个用于miRNA-seq数据分析的集成化工作流程,它包括质量控制、比对、表达量分析、功能富集分析和miRNA-蛋白相互作用网络构建等步骤。此外,还有研究通过miRNA-seq探讨了体液鉴定中miRNA标记物的筛选与验证,这对于法医学等领域具有重要意义。
miRNA高通量测序技术的发展为理解miRNA在生物体中的功能和在疾病中的作用提供了强有力的工具。随着技术的不断完善和成本的降低,预计miRNA-seq将在未来的生物医学研究中发挥越来越重要的作用。