电力系统继电保护是一个有机整体，微机继电保护测试仪专业应实行统一领导，分级管理。在网局、省局、地（市）电力局及发电厂设置继电保护专业机构。网局、省局分别在中调所设置继电保护科作为局继电保护技术管理的职能机构，履行专业管理的职能，实现全网、全省继电保护的专业领导，负责所辖系统继电保护的整定计算及运行管理等工作。地（市）电力局继电保护整定计算及技术管理，一般设在调度所。在地（市）电力局、发电厂的检修分场或变电工区（检修部）设立继电保护班组，负责全局或全厂的继电保护设备的运行、维护及定校工作。
微机继电保护测试仪工作专业技术性很强，一根线一个接点的问题可能造成重大事故，所以继电保护机构必须配备事业心强，工作认真细致，努力钻研技术，具有较高理论知识的专业技术人员。各级继电保护部门必须建立岗位责任制，使每项职责落实到个人。各单位领导要重视继电保护工作，充实配备技术力量，调动继电保护工作人员的各级性，保持继电保护队伍的稳定。
对微机继电保护测试仪的定值管理，应结合电力系统发展变化，定期编制或修订系统继电保护整定方案。整定方案的编制依据：经领导审定的系统运行方式及运行参数，包括正常和实际可能的检修运行方式、zui大有功及无功潮流（必要时应包括冲击电流值，电动机的自起动电流值等），zui低运行电压、非全相运行的线路的相序分量、*重合闸时间、解列的具体要求等。重要的发电机及110kV以上系统所需的设备及参数，必须采用实测值。整定方案编制后，在本继电保护部门内应经专人进行全面校核，然后经调度（值长）、运行、生技、安监等部门讨论，由总工程师批准后实施。整定计算原始底稿应整理成册、妥善保管，供日常运行或事故处理时查对。现场微机继电保护测试仪装置整定值的调整，应按保护装置整定通知单的要求进行，并依照规定日期完成。
对运行中的保护装置，应按照有关规定进行定期检验，基层局、厂继电保护部门，需根据季节特点、负荷情况并结合一次设备的检修，合理地安排年、季、月的保护装置检验计划。定期检验工作应保证检验质量，掌握进度，及时完成。继电保护装置检验后，应向运行人员交待，并填写微机继电保护测试仪工作记录。在运行中严禁无保护的设备投入运行，重要主保护撤出运行须经总工程师批准。当保护装置发生不正确动作，应及时向上级继电保护部门及整定管辖部门报告，并保留现场原状态，及时进行事故后的现场检验，检验项目根据不正确动作的具体情况确定，重大事故的检验工作要与上级继电保护及安监部门商定，并应有中调所、电力试研所参加分析，找出不正确动作原因，制定对策。运行部门平时应加强设备巡检，在高峰负荷来临之前开展设备安全大检查及保护传动试验。
对于新建工程，微机继电保护测试仪和自动装置必须与工程同时投运。新安装的保护装置竣工后，应进行验收工作，防止因安装调试不良发生不正确动作或事故。