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NanoDrop 2000-Thermo NanoDrop 2000紫外分光光度
Thermo NanoDrop 2000紫外分光光度计是NanoDrop的产品,应用液体的表面张力特性,样品体积只需要0.5~2ul,在检测台上,经上下臂的接触拉出固定的光径达到快速、微量、高浓度、免石英管、免毛细管等耗材检测吸收值的优点。此产品设计受保护,并在全普遍广受欢迎,其准确度与便利性让科学家得以更有效率进行各项研究。
Thermo NanoDrop 2000紫外分光光度计使用高能量氙灯(pulsed xenon flash lamp)可提供190~840nm的全光谱检测,且不需要暖机,开机后立即使用。搭配高感度CCD array检测器,检测吸收值可高达300Abs(dsDNA浓度2~15000ng/ul),大部分纯化后的核酸几乎都不需要稀释即可检测。
待测样品的均质性是NanoDrop 2000的较为高要求,一般核酸、蛋白质样品能在检测前以vortex mixer震匀为较为匀,若无vortex mixer也应以pipette吸放数次混匀。若担心genomic DNA可能因前述动作而断裂,则改以55?C加热约一分钟,使样品在侦测前呈现均匀状态,以确保 2ul 具有代表性。
检测时选择不同检测模式,可以得到较为快速的结果:
● Nucleic Acid – 吸收光谱、230nm, 260nm, 280nm吸收值(换算成10mm光径吸收值)、260/280 ratio、260/230 ratio及核酸浓度。
● UV-Vis – 190~840nm间所有波长的吸收值及光谱(以1mm光径吸收值呈现)。
● A280蛋白质定量法 – 280nm吸收值(换算成10mm光径吸收值)、260/280 ratio及蛋白质浓度。仅适用于纯化后的蛋白质,须具有已知的质量消光系数(mass extinction coefficient)方可计算。
● BCA、Bradford及Lowry – 依不同呈色剂提供不同波长吸收值结果,自动画出标准曲线并计算R square,待测蛋白质浓度。
* 蛋白质检测模式目前提供BCA、Bradford及Lowry三种常见定量呈色剂,因呈色剂随时间会逐渐加深,使用前请详阅试剂说明书并制备不同浓度的标准品,在较为快时间内完成检测,以得到良好的标准曲线。每个标准曲线较为多可有七个标准品,每个标准品较为多可做五重复。
* 测蛋白质时样品体积需使用 2ul,每个样品检测后需以Kimwipes 低尘擦拭纸(编号: 34155 )擦拭15~20回,以避免呈色剂与蛋白质的残留。
浓度范围:
样品种类 | 较为低浓度 | 较为高浓度 (*过时请稀释样品) | 再现性 (五重复以上) |
核酸 | 2 ng/ul | 15000 ng/ul (dsDNA) 12000 ng/ul (RNA) | 浓度范围在 2-100 ng/ul 时,SD为 ± 2 ng/ul 浓度范围大于 100 ng/ul 时,CV为 ± 2% |
纯BSA | 0.10 mg/ml | 100 mg/ml | 浓度范围在 0.05-10 mg/ml 时,SD为 ± 0.10 mg/ml 浓度大于 10 mg/ml 时,CV为 ± 2% |
蛋白质,以BCA方式定量 | 0.2 mg/ml | 8.0 mg/ml | CV:± 2% (在可侦测的浓度范围内皆然) |
蛋白质,以modified Lowry方式定量 | 0.2 mg/ml | 4.0 mg/ml | CV:± 2% (在可侦测的浓度范围内皆然) |
蛋白质,以Bradford方式定量 | 100 ug/ml | 8000 ug/ml | 浓度范围在 100-500 ug/ml 时,SD为 ± 25 ug/ml 浓度大于 500 ug/ml 时,CV为 ± 5% |
蛋白质,以Mini Bradford方式定量 | 15 ug/ml | 100 ug/ml | 浓度范围在 15-50 ug/ml 时,SD为 ± 4 ug/ml 浓度大于 50 ug/ml 时,CV为 ± 5% |
NanoDrop ND-2000C
产品描述:
NanoDrop ND-2000C为NanoDrop ND-2000的升级版本,ND-2000C具有ND-2000全部功能,除此之外,它还有以下突出特点:
1、检测耗时更短,仅需3秒钟;
2、具比色杯或者检测孔两种选择,适合检测各种类型的样本,包括易挥发性物质的检测;
3、检测范围更加宽泛,检测下限可低至0.4 ng/μl (dsDNA);
4、内置比色杯,可进行实时动力学曲线研究,或者OD600细胞浓度的测量。
ND-2000C技术参数:
检测孔测量时:
1、波长范围: 190-840nm;
2、波长精度: 1nm;
3、分辨率: <1.8 nm (FWHM at Hg 253.7 nm);
4、其它: 1mm光程长度(可自动调整到0.05mm);
5、检测下限:2ng/μl(dsDNA);
6、检测上限:15000ng/μl(dsDNA);
7、吸光率度:0.002 absorbance (1mm光程);
8、吸光率准确性:2%(at 0.76 at 257 nm);
9、吸光率范围:0.02-300 (相当于10mm光程);
10、核酸检测周期:< 5s;
11、体积:14cm×20cm。
比色杯测量时:
1、光柱高度:8.5 mm;
2、控温,37 ± 0.5 °C;
3、搅拌速度: 150 – 850 rpm;
4、四种光径可供选择,分别为1,2,5,10mm;
5、吸光率范围:0.002 – 1.5;
6、检测下限:0.4 ng/μl (dsDNA);
7、检测上限:750 ng/μl (dsDNA);
8、检测时间:< 3 s;
9、重量:2.1 kg.
二、使用方法舉例
dsDNA:
在主畫面點選Nucleic Acid,電腦與儀器自動完成連線。依照DNA所溶於之液體準備該溶液(務必確認DNA溶於二次水、TE buffer或哪一組kit的elution buffer)取出1.5 ul 點在偵測台上,放下上臂後再按Blank。在右上方拉選Sample Type 選 DNA-50,在Sample ID位置輸入樣品名稱,將樣品混勻,取出1.5 ul 點在偵測台上,放下上臂後再按Measure。點此觀看操作影片。
結果:
DNA濃度即以 9.691 x 50 = 484.5 算出。 260/280介於1.8~2.0通常代表此為較純的DNA(隨DNA組成不同會有差異)。 260/230高於260/280,介於1.8~2.2通常表示純化過程殘留污染物較少。若欲察看220~340nm間其他波長的吸收值,可使用滑鼠拉動位於230nm的直線,或在右邊λ處輸入其他波長數值。
三、結果整理:
NanoDrop2000 軟體在偵測一開始會詢問檔案欲存至何處,若未,則檔案會存在上一個使用者的檔案內。點此觀看或下載 Data 功能使用說明。
四、注意事項:
1. 偵測後立即使用拭鏡紙(Kimwipe類)擦拭台面。先取一張將上下台面的液體吸走,再將此laboratory wipe吸過樣品的面反折到內部,折疊四次後以單方向多次擦拭台面(DNA 擦 5次,Protein 擦 20次)。
2. 同一滴液體只能做一次偵測,欲重複定量同一樣品,請擦掉前一滴,重新取出一滴進行偵測。
3. 基本上核酸樣品可使用1~2ul做測量,隨各液體體積特性之不同會有不同體積需求,原則上不*過 2ul。並請使用2ul pipette避免體積不足導致液柱無法完整形成。唯蛋白質樣品因呈色劑與蛋白質本身特性,務必使用2ul進行偵測。
4. 當軟體跳出錯誤訊息時,請詳細閱讀並依指示進行障礙排除。常發生的情形是在偵測過程液柱並未正確形成,軟體會出現以下訊息。可先用肉眼觀察液柱是否未完整連接上下台面,或樣品內有泡泡,將上臂拉起後,擦掉該滴樣品,再重新進行偵測,必要時可將樣品體積加大至2ul。
正確的液柱應為:
5. 不可使用含有Hydrofluoric Acid (HF)之樣品,其他無腐蝕性之液體皆可使用。
五、日常與定期維護:
1.平時保持台面及儀器本身清潔。
2.定期校正。
常見問題:
問 1. 使用多少液體做測量?
答 1. 2ul,基本上可使用 0.5~2ul 做測量,隨各液體體積特性之不同會有不同體積需求,原則上不*過 2ul。並請使用2ul pipette 避免體積不足導致液柱無法完整形成。
問 2. 如何清潔台座?
答2. 使用 laboratory wipe 將上下座的液體吸走,再將此 laboratory wipe 吸過樣品的面反折到內部,折疊四次後以單方向多次擦拭台面(DNA 擦 5次,Protein 擦 20次)。點此觀看清潔台座影片。
問3. 儀器多久需要校正?
答3. 每台儀器出廠前皆經過多次測試,並附上測試報告。新機一年校正一次,之後建議每半年再進行一次校正。本公司備有一年兩次的校正合約,以原廠標準程序進行定期校正。若有特殊狀況亦可個案處理。
問4. 燈源多久需要更換?
答4.一般而言儀器內一個氙氣燈可偵測 350萬個樣品,依供電及實驗室環境會有些微差異。若儀器在初始化時反覆出現錯誤訊息,請進入Diagnostics內進行燈源強度確認,若看不見任何光譜,即為燈源壽終之訊息。
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