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被高估了的突变率

时间:2018-05-08      阅读:219

 

病毒变化异常迅猛。然而,苏黎世联邦理工大学(ETH)生物系统科学和工程系教授Tanja Stadler利用西非zui后一次埃博拉大流行爆发初期证据证明,病毒变异速度过快可能是计算方法偏差所致,2014年,埃博拉病毒流行病爆发,一个小组根据病毒样本和计算机模拟估计,病原体基因组每9.5天就会发生一次变化,这个估值是相当高的,通常,埃博拉病毒基因组变异率仅为该速度的一半。如此高的突变率导致了民众恐慌,因为,如果病毒高速变异,它将很快变得更毒。

随后,研究人员评估大量病毒样本却无法证实这个突变率,事实上,整个流行病期间,病毒的变异速度都很正常。

时隔四年,ETH的研究人员终于证实,当时高突变估值是由于流行病爆发初期病毒样本数量有限和计算模型设计缺陷所致。

计算机建模时遗传数据样本量越小,对zui终结果预测的误差越大。她强调,基于一个小数据集的埃博拉疫情早期估计被证明是不准确的。

如今的计算模型更为复杂,例如新模型不再假设所有受感染者将病原体传递给其他人的机会相同,相反,新模型考虑到了不同的人口结构。Stadler课题组开发的基于大量计算的新模型能提供更准确的结果,即使在流行病刚开始,遗传数据样本还很小的时候。

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