五、模块的材料及形状
从均匀性的角度来讲，模块为银做是好，其次是铜，然后是铝合金。市场上一般用的模块都是铝或银。主要是因为铜的体积比热容太大，不利于升降温速率。银也有同样的问题，因此市场上的银模块其实都是空心的。但做成空心的后，其对温度均匀性有负面的影响。因此市场上的银模块仪器的温度均匀性并不比铝合金的高，但升降温度速率要高些。由于银容易氧化，因此银模块有的是镀金的（不要以为是纯金的或是整块金或银的），有的是表面氧化处理后发灰的。
铝合金的模块也有形状问题，体积大且孔间连接多有利于均匀性，但不利于升降温速率。各个厂家在模块形状上也是下了功夫的，都是一个平衡。

六、升降温速度
升降温速度是PCR仪的另一个重要指标（以后再讨论），升降温速度过高也会影响温度的均匀性。因为升降温速度高，模块来不急传热，半导体片差异及传热造成的温度差会更大。
另外，用户使用PCR仪要的是管内的温度，而仪器能测到的是模块下传感器的温度，通过理论和实验的结果计算出来的管内温度与实际温度是有差别的，升降温速度越快，其差别也越大。
总之，除了以前谈到的六大因素之外，还有其他一些影响因素，如传感器的温度漂移、温度处理电路的老化、散热器的灰尘不均匀等。有些因素可以通过定期的校准和保养来减轻或消除。