荧光成像显微镜具有以下优点：

1)灵敏度高，可探测微弱的荧光图像

2)对测定物质的定性或定量分析，实现荧光准确定位

3)通过切换滤块,能够实现荧光成像与暗场成像的共定位

4)对细胞的刺激性小，能够进行多重染色检测研究分析，适合于观察切片和活细胞

当然，荧光成像显微镜也会存在一些不足，主要是细胞在可见光区有自发荧光，掩盖了标记分子信号，难以实现对分子的长期标记检测。因此对于生命科学的研究，荧光成像技术也是在不断改进中。

荧光成像技术的应用：

蛋白质、金属离子的检测

肿瘤疾病的检测和诊断

药物新剂型研究

目前荧光成像显微镜已成为各个实验室及成像平台的标配成像设备，是我们日常实验研究的好帮手。荧光显微镜主要分为三大类：正置荧光显微镜（适合切片）、倒置荧光显微镜（适合活细胞，兼顾切片）、体视荧光显微镜（适合较大标本，如植物、斑马鱼（成体/胚胎）、青鳉、小鼠/大鼠器官等）。