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免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法,是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。免疫共沉淀具有经翻译后修饰的,处于天然状态的优点。
免疫共沉淀(CHIRP)实验意义
IncRNA可与蛋白质、DNA和RNA相互作用,实现多样化功能,CHIRP可以探讨IncRNA与其互作的DNA.蛋白质的功能与作用机制,是相关科学研究工作的有力工具。IncRNA的研究在表观遗传调控等生命活动中发挥重要作用,CHIRP是研究
IncRNA的重要技术手段,可在全基因组范围内鉴定RNA与染色质的互作,并对其进行定性、定量及定位的分析。
免疫共沉淀(CHIRP)实验原理
CHIRP (Chromatin Isolation by RNA Purification)是通过结合生物素的核酸探针,将目标RNA拉下来,与之共同作用的DNA染色体片段(DNA与蛋白质复合体)就会被吸附下来,后可以通过qRT-PCR. WB.测序分析和质谱分析等检测RNA. DNA和蛋白质。
CHIRP的实验流程
①探针设计:设计反义穿核苷酸探针:
②细胞培养;
③破碎细胞:
④生物素标记的DNA探针与RNA杂交;
⑤CHIRP;
⑥RNA、DNA及核酸结合蛋白提取; .
⑦分析检测。,
结果展示
实验完成周期及交付标准
1.实验周期: 1-3个月
2.交付标准: CHIRP鉴定结果报告、分析报告、实验报告(试剂、 耗材、实验步骤)、原始数据等
实验需与客户确认的信息
1.目的基因与蛋白信息。
2.样本类型与种属
3.是否需要生信分析
注意的问题:
(1)细胞裂解采用温和的裂解条件,不能破坏细胞内存在的所有蛋白质-蛋白质相互作用,多采用非离子变性剂(NP40或Triton X-100)。每种细胞的裂解条件是不一样的,通过经验确定。不能用高浓度的变性剂(0.2%SDS),细胞裂解液中要加各种酶抑制剂,如商品化的cocktailer。
(2)使用明确的抗体,可以将几种抗体共同使用。
(3)使用对照抗体:
单克隆抗体:正常小鼠的IgG或另一类单抗
兔多克隆抗体:正常兔IgG
实验代做服务: