荧光定量PCR(SYBR Green)总RNA提取方法步骤
时间:2023-12-04 阅读:299
总RNA提取:
A组织样本:迅速将新鲜的组织切成合适的大小,在液氮中充分研磨后加裂解液裂解,或直接加入裂解液后用匀浆器匀浆。每30-50mg组织加1ml Trizol。
B全血样品:加入3-5倍体积的红细胞裂解液到血样中,室温孵育10min,室温3500rpm离心6min。弃上清,原每2-3ml全血样品加1mL Trizol。
C细胞样品:悬浮液中生长的细胞,通过离心收集细胞后,每1×105〜106细胞加入1mL Trizol,移液器吹打混匀,直接裂解或-80℃储存一个月。贴壁生长的细胞,有两种处理方法。一种是移除培养基后,将1mL Trizol直接加入直径3.5cm的培养皿中裂解细胞。或是先用胰蛋白酶将贴壁细胞消化下来并收集后,再加入1mL Trizol进行裂解。(Note:加入Trizol前, PBS充分洗涤细胞去除残余培养基。)荧光定量PCR(SYBR Green)总RNA提取方法步骤如下:
1、直接法
1)加入1ml Trizol试剂,混匀,冰上孵育10min。
2)4℃,12000rpm离心10min,小心转移上清液到不含颗粒的新EP管中。
3)加入200ul氯仿,剧烈振荡15秒,室温孵育5min。
4)4℃,12000rpm离心15min。混合液分三层,包括最下面的苯酚 - 氯仿有机相,中间相和上层水相。小心转移上层水相到新的EP管(大约60%体积的Trizol),不要吸取中间相,可留下少量上层液体!(Note:质量比数量更重要!)
5)加入等体积的异丙醇,轻轻地颠倒混匀约10次,室温放置10min。
6)4℃,12000rpm离心10min。弃上清,1ml 75%乙醇洗涤RNA沉淀两次。
7)4℃,12000rpm离心5min,弃上清,室温下风干5-10min(不要太干,过度干燥会导致RNA难溶解!)。将RNA溶于15μl-50μlDEPC水中。
8)立即进行反转录反应,或先-80℃长期保存。
2、离心柱法(依据RNA提取试剂盒说明书)
1)1、中步骤1)—4)。
2)加入1/2体积的无水乙醇,轻柔颠倒混匀。如有透明的纤维状物体,不影响下游步骤。
3)将所有裂解物/乙醇混合物转移至离心柱,置于2mL,静置2min。4℃,12000rpm离心3min,弃废液。
4)加入500uL洗涤液,静置2min。4℃,12000rpm离心30秒,弃废液。重复一次。
5)4℃,10,000rpm离心2min以除去残留的乙醇。
6)将离心柱置于新的RNase-free EP管中,加入30ul-50ulDEPC水,静置5min, 12000rpm离心2min收集。
7)立即进行反转录反应,或先-80℃长期保存。