PerkinElmer唾液样品优化方案之利器—珠磨均质器
时间:2021-07-21 阅读:579
实验案例
日前来自美国佐治亚州奥古斯塔大学Augusta University的多位科学家利用PerkinElmer的SAR-CoV-2检测方案对来多个自医疗机构和社区收集到的429份对应的鼻咽拭子和唾液样品进行检测,以分析唾液样品、鼻咽拭子的检测效果,以及利用唾液样品检测优化方案后的检测效果。
样本处理和SARAS-CoV-2分析工作流程示意图概述:对在医疗机构和社中采集的对应鼻咽拭子和唾液样本进行测试和验证。1、U方案:使用U方案对鼻炎拭子或唾液样本进行SARS-CoV-2检测流程(唾液样品不经过均质,直接用于RNA提取);2、SalivaAll方案:使用SalivaAll方案对唾液样本进行核酸检测流程(在唾液样品提取RNA之前利用珠磨机均质器进行唾液均质化步骤);3、SalivaAll混样方案:唾液样本均质后按5:1进行混样,然后进行RNA提取、RT-PCR检测。
实验流程及结果如下
U方案通过RT-PCR检测240个对应的鼻咽拭子和唾液样本的SARS-CoV-2。结果显示 28.3%(68/240)的样本从唾液、鼻咽拭子或两者中检测出SARS-CoV-2阳性。唾液中的检出率50.0%(34/68)低于鼻咽拭子的检出率89.7%(61/68)。
SalivaAll方案对189个对应的鼻咽拭子和唾液样本进行了检测,在提取RNA之前利用BeadBoost珠磨均质器对唾液样品进行样本均质化步骤,然后进行核酸提取、RT-PCR。结果显示,50.2%(95/189)的样本从唾液、鼻咽拭子或两者中检测出SARS-CoV-2阳性。唾液中SARS-CoV-2的检出率97.8%(93/95)高于鼻咽拭子检出率78.9%(75/95)。
U方案与SalivaAll方案比较:对U方案检测的85份唾液样本用SalivaAll方案再次进行检测,对两种方案进行评估。在两种方案评估的85份唾液样本中,57.6%(49份)的SARS-CoV-2检测呈阳性,在U方案、SalivaAll方案或两者皆有。唾液样品SalivaAll方案的检出率为100%(49/49),而U方案的检出率为36.7%(18/49)。
SalivaAll混样方案根据FDA5:1的混样建议,分别利用1个阳性样品和4个阴性样品混成阳性混样,利用5个阴性样品混成阴性混样。阳性混样和阴性混样各混20个样品。利用SalivaAll混样方案,唾液样本均质后每个样品取60ul进行混样,5个样品总体积为300ul混样,然后进行RNA提取、RT-PCR检测。结果显示,20个阳性混样的检测准确性为95%,阴性混样的检测准确性为100%。
研究表明传统的SARS-CoV-2核酸检测流程在唾液样本的操作和检测灵敏度等方面具有一定的挑战。通过PerkinElmer优化的唾液样品检测方案,在RNA提取之前加上唾液样品均质处理步骤,检测结果灵敏性大幅提升,检测灵敏度高于鼻咽拭子,同时可以对唾液样品进行混样检测。
此款珠磨均质器先进技术来自OMNI International公司,PerkinElmer已于 2021年1月正式收购OMNI International,这是一家专业的样品均质技术公司。OMNI的珠磨均质技术是PerkinElmer新推出并获CE认证的SARS-CoV-2唾液检测流程的一个关键组成部分。进一步完善了PerkinElmer基因组学全流程解决方案。PerkinElmer致力于为客户提供满足其科研和临床测试需求的完整解决方案。