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兼容常规与链特异性mRNA文库构建

时间:2019-10-30      阅读:1137

Hieff NGS® MaxUp II Dual-mode mRNA Library Prep Kit for Illumina

——兼容常规与链特异性mRNA文库构建

背景简介

RNA被认为是生物信息传递的“桥梁”。而转录组测序可利用NGS技术对组织或者细胞中的RNA反转录之后的cDNA文库测序,通过分析可计算不同RNA的表达量、发现新的转录本、进行转录本定位、分析可变剪切、检测基因融合等,提供全面的转录组信息。

 

图 遗传学中心法则

目前主流的mRNA建库主要流程是mRNA纯化,mRNA逆转录,双链cDNA合成,末端修复,A尾添加,接头连接,纯化/分选,文库扩增,时间上需要1.5 d甚至更久。

翊圣生物结合自身多年的分子酶创新研发经验,推出升级版快速mRNA建库试剂盒,可在短的时间进行建库。助力获得优异的转录组测序数据。

 

亮点一览

1、建库快速:完整建库比主流方法缩减1.5-2 h,1 d内获得高质量文库。

 

图 升级版建库试剂盒建库流程

2、兼容常规与链特异性文库构建

本产品搭配两种二链合成buffer,即含dNTP(常规建库)与dUTP(链特异性建库),可兼容两种模式的mRNA文库构建。一个盒子两种用处,不用再额外备货。

3、逆转录酶,更适合复杂模板

RNaseH能特异的降解RNA-DNA杂交分子中RNA的特性,将RNA降解成小片段,影响反转录效率。YEASEN提供的第四代Hifair逆转录酶,去除RNase H活性,同时温度的耐受性高达65℃,有利于复杂RNA模板二级结构的打开,更利于逆转录的进行。

 

 

硬核支撑

以1 μg的标准品RNA(Agilent#740000)为起始,分别构建链特异性文库和非链特异性文库,质控后的文库用illumina Hiseq X-10 PE150测序。

a. 优异的测序质量

 

b. 表达重复性高

 

c. 优异的文库均一性

 

d. rRNA残留更低,有用数据更多

 

 

e. 链特异性建库:98.5%的Reads比对到正义链上

 

 

客户案例

单位:广州某生物公司J*

样本:草莓,油菜,核盘菌

结论:高质量文库,优异的测序数据

a. 文库报告

 

b. 测序质量

 

c. 数据比对

 

d. 数据分布

 

e. 基因覆盖度分析

 

单位:上海某生物公司O*

样本:人,大鼠,西瓜

结论:高质量文库,优异的测序数据

a. 建库报告

 

b. 测序质量

 

c. 数据比对

 

d. 数据分布

 

e. 基因覆盖度分析

 

 

相关产品:

 

类型

名称

货号

规格

建库试剂盒

Hieff NGS® MaxUpⅡ Dual mode mRNA Library Prep Kit for Illumina®

12300ES24/96

24/96 T

mRNA富集磁珠

Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit

12603ES24/96

24/96 T

rRNA去除试剂盒

Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

12253ES24/96

24/96 T

RNA纯化磁珠

Hieff NGS® RNA Cleaner

12602ES56/75

60/450 mL

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