上新 | 多样本适用，16S扩增子建库利器来袭！
时间：2024-10-15 阅读：102
微生物群落多样主要包括物种多样性、遗传多样性和功能多样性3个方面，在环境、能源、食品与人体健康等诸多领域有着广泛的研究与应用。16SrRNA扩增子测序技术是微生物群落多样性检测常用的组学技术之一，该技术无需对微生物分离培养，直接提取样本里面所有微生物的基因组，利用合适的通用引物扩增16S rDNA/18S rDNA /ITS等高变区或功能基因，采用高通量测序仪Miseq、Hiseq或Novaseq对其进行测序，通过生物信息学分析可以获得特定实验样品中细菌、真菌或古菌等的物种组成、物种丰度、系统进化、群落比较等诸多信息。
16S rDNA测序
16S rDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列，具有10个保守区域和9个可变区域，其中保守区在细菌间差异不大（反映了生物物种间的亲缘关系），可变区具有属或种的特异性。对16S rDNA某个可变区进行测序，可用于研究微生物中细菌或古菌的群落结构多样性。
原核微生物的16S rRNA基因长度约为1500 bp，二代测序平台对应扩增引物一般选用V3-V4区域或V4区域，三代测序平台可选用全长扩增引物（27F/1492R）。
图1. 16S rDNA基因序列组成示意图
（蓝色为可变区，白色为保守区）
18S rDNA测序
18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。对 18S rDNA某个高变区进行测序，用于研究环境样本中真核微生物群落结构多样性。
真核微生物18S rRNA基因长度1500-2000 bp，引物一般选用V4区域。
图2. 18S rDNA基因序列组成示意图
（蓝色为可变区，白色为保守区）
ITS测序
ITS分为两个区域：ITS1和 ITS2，ITS1位于真核生物rDNA序列18S和 5.8S之间，ITS2位于真核生物rDNA序列5.8S和28S之间。对ITS1（350 bp）或ITS2（400 bp）进行测序，用于研究环境微生物中真菌群落结构多样性。
ITS区长度则为400-900 bp，引物一般选用ITS1区域。
（蓝色为可变区，白色为保守区）
宏条形码测序
目标区域扩增子测序
产品介绍
16S rDNA文库建库试剂盒利用高通量测序技术对16S rDNA中V3-V4或V4区片段进行扩增，结合生物信息学技术，检测特定环境下的微生物，鉴定所检细菌种类，提供环境样本物种分类、物种丰度、种群结构、系统进化等诸多信息。试剂盒中包含进行细菌16S rDNA扩增的所有试剂、16S PCR扩增引物F/R，组合Illumina 和MGI平台 Index 引物试剂盒用于16S rDNA片段的扩增。
产品应用
科学研究：进行微生物群落结构和功能研究；
临床监测：用于疾病诊断、感染控制和治疗监测；
环境监测：评估环境样本中的微生物多样性和污染情况；
农业研究：研究土壤微生物群落对作物生长的影响；
能源领域：特殊功能的菌株、基因挖掘、工程菌的开发；
食品相关监测：检测和控制食品中的微生物污染。
产品特点
适用多样本类型：兼容大多数常见环境样本，如土壤、粪便、水体、生物膜等；
高效率扩增：灵敏度低至0.1 ng，特异性优，均一性好；
测序数据质量高：低背景、高覆盖度、高均一性。
性能展示
产品信息
应用方向 | 产品名称 | 货号 | 规格 |
提取试剂盒 | MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit 磁珠法土壤/粪便DNA提取试剂盒 | 18526ES20 | 20 T |
18526ES50 | 50 T | ||
16S rDNA鉴定 |
16S（V3-V4）Bacterial AmpSeq Prep Kit ForIllumina | 12983ES08 | 8 T |
12983ES24 | 24 T | ||
12983ES96 | 96 T | ||
16S（V4）Bacterial Metagenomic Library Construction Kit For MGI | 12933ES08 | 8 T | |
12933ES24 | 24 T | ||
12933ES96 | 96 T | ||
16S/18S/ITS/宏条形码/功能基因扩增子等 | 2×Hieff NGS® HG MμLtiplex PCR Master Mix | 13283ES03 | 1 mL |
13283ES08 | 5×1mL | ||
16S 全长多重扩增试剂 | 2×Hieff® Ultra-Long PCR Master Mix | 10158ES03 | 1 mL |