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一步法同源重组

时间:2017-09-07      阅读:4249

 

不让您宝贵的克隆留下“疤痕”!

提起传统酶切连接克隆或载体构建,什么让大家苦不堪言?  

A:每次都要纠结于各种限制性内切酶的选择。                    

B:操作步骤繁琐,耗时长,至少需三四天才能完成。

小C每次只能克隆1个目的片段。

D:片段结合位置上有时会留下“疤痕”。

······

忘记苦难,今天小编给大家介绍一种新的克隆方法—一步法同源重组技术,带你们脱离苦恼!

一步法同源重组一种利用同源重组的原理,进行无缝克隆的技术。该技术无需考虑酶切位点,几乎适用于任何载体与任何片段的定向克隆。操作过程简单快速,只需50℃,20min即可完成反应。劲爆的是,多个片段也可以同时克隆哦!

 

激动宝宝小C:如此厉害,是如何做到呢?

【秘】一步法同源重组的关键在于重组酶它由三种酶混合而成分别是外切酶,DNA聚合酶和连接酶。

外切酶活性:该酶能沿着5’→3’方向,降解双链DNA,从而产生黏性末端,这样便于与另外的同源末端进行配对结合(两个同源序列通过外切酶的切割,能产生几乎一致的黏性末端)。

DNA聚合酶活性:外切酶作用后,并不能保证将每一个片段的5’末端都降解成一样长的黏性末端,同源末端退火配对后,极可能存在缺失的碱基。此时需要借助DNA聚合酶进行修复缺口。

连接酶活性:催化形成磷酸二酯键,将所有缺口补齐,实现无“疤痕”拼接,即无缝克隆。

好奇宝宝D:外切酶降解双链DNA多长呢?是否会把双链DNA切割成单链导致无法进行片段重组呢

莫担心自有妙招的重组反应温度是50℃远高于外切酶的zui适温度(37℃),此外,外切酶的含量较低,故重组反应体系中很快会失去外切酶活性。对于200bp以上的双链DNA-片段都是*不用担心的,当然,几十bp的小片段是不适合同源重组的。

心急宝宝小B:这么牛掰的,快给我们讲讲怎么操作吧。

步骤1:制备载体

需将线性化载体的制备好,既可以选择酶切,也可以选择PCR的方式制备线性化载体。

步骤2:设计目的片段引物

在目的片段上下游引物的5’端引入15-25bp左右载体末端同源序列

步骤3:扩增目的片段

通过PCR的方法,使目的片段的两端加上了与载体末端相应的同源序列。

步骤4:重组反应

按比例混合线性化载体和目的片段50℃反应20 min。

步骤5:转化,鉴定

将重组产物直接转化后涂平板,挑取克隆进行阳性鉴定。

 

机智宝宝小A:有啥应用呢?

可以应用于定点突变,CRISPR,构建多顺反子表达载体等等

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