一步法同源重组
时间:2017-09-07 阅读:4305
不让您宝贵的克隆留下“疤痕”!
提起传统酶切连接克隆或载体构建,什么让大家苦不堪言?
小A:每次都要纠结于各种限制性内切酶的选择。
小B:操作步骤繁琐,耗时长,至少需三四天才能完成。
小C:每次只能克隆1个目的片段。
小D:片段结合位置上有时会留下“疤痕”。
······
忘记苦难,今天小编给大家介绍一种新的克隆方法—一步法同源重组技术,带你们脱离苦恼!
一步法同源重组是一种利用同源重组的原理,进行无缝克隆的技术。该技术无需考虑酶切位点,几乎适用于任何载体与任何片段的定向克隆。操作过程简单快速,只需50℃,20min即可完成反应。劲爆的是,多个片段也可以同时克隆哦!
激动宝宝小C:如此厉害,是如何做到呢?
【秘】一步法同源重组的关键在于重组酶。它由三种酶混合而成。分别是外切酶,DNA聚合酶和连接酶。
外切酶活性:该酶能沿着5’→3’方向,降解双链DNA,从而产生黏性末端,这样便于与另外的同源末端进行配对结合(两个同源序列通过外切酶的切割,能产生几乎一致的黏性末端)。
DNA聚合酶活性:外切酶作用后,并不能保证将每一个片段的5’末端都降解成一样长的黏性末端,同源末端退火配对后,极可能存在缺失的碱基。此时需要借助DNA聚合酶进行修复缺口。
连接酶活性:催化形成磷酸二酯键,将所有缺口补齐,实现无“疤痕”拼接,即无缝克隆。
好奇宝宝小D:外切酶降解双链DNA多长呢?是否会把双链DNA切割成单链导致无法进行片段重组呢?
莫担心,自有妙招!的重组反应温度是50℃,远高于外切酶的zui适温度(37℃),此外,外切酶的含量较低,故重组反应体系中很快会失去外切酶活性。对于200bp以上的双链DNA-片段都是*不用担心的,当然,几十bp的小片段是不适合同源重组的。
心急宝宝小B:这么牛掰的,快给我们讲讲怎么操作吧。
步骤1:制备载体
需将线性化载体的制备好,既可以选择酶切,也可以选择PCR的方式制备线性化载体。
步骤2:设计目的片段引物
在目的片段上下游引物的5’端引入15-25bp左右载体末端同源序列。
步骤3:扩增目的片段
通过PCR的方法,使目的片段的两端加上了与载体末端相应的同源序列。
步骤4:重组反应
按比例混合线性化载体和目的片段,50℃反应20 min。
步骤5:转化,鉴定
将重组产物直接转化后涂平板,挑取克隆进行阳性鉴定。
机智宝宝小A:有啥应用呢?
可以应用于定点突变,CRISPR,构建多顺反子表达载体等等。
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