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蛋白组学样本前处理工作站是一款具备高通量、高回收率、安全性能强、抗干扰能力强,适用范围广等优势,适用大队列样本的高通量处理设备,可实现质谱蛋白样本前处理的全自动化和标准化操作。
蛋白组学样本前处理解决方案适用于血浆、血清、尿液、细胞、组织等类型样本从蛋白到多肽混合物的质谱检测前处理工作,试剂盒利用新型固相烷基化试剂SPA材料与蛋白的特异性共价反应,实现蛋白质的高效捕获,通过清洗磁珠表面,快速去除干扰物质,并进行原位固相酶解,获得蛋白酶解产物,仪器整合制冷模块、磁吸附模块、加热振荡模块、抓扳手,进而实现蛋白质组提取、还原、烷基化、酶解等流程自动化操作,提高蛋白质样品的处理效率和回收率。
优势特点 |
高通量
■96通道移液头,一次可处理最多96个样本,高效完成实验流程中吸废等步骤;
■兼具8通道移液功能,可以实现试剂的精准分装;
■ 全流程4-5小时可完成96个蛋白样本的前处理(具体时间根据具体实验流程);
自动化程度高
■ 整合抓板手,用于对标准SBS板子的转移;
■ 整合蛋白前处理所需的试剂制冷模块、磁吸附模块、加热振荡模块等功能模块;
■均一化操作,减少实验过程中的误差,提高准确性和稳定性;
灵活性强
■ 盘面包含18个SBS标准盘位,除功能模块外,有15个盘位放置试剂和耗材;
■开放式平台,配有多样化适配器,可适配多种不同品牌试剂耗材;
■软件界面人性化设计,拖拽式布局,操作简单,每个步骤可独立进行参数设置,实验流程可进行存储,按键式启动运行;
安全性
■可配置避光外罩,搭配紫外消毒灯;
■可根据实验需求选配正、负压HEPA过滤系统,有效避免交叉污染;
数据测试 |
样本批内测试数据
材料:293T 细胞
实验方法:手工操作3 组,仪器操作3 组
Q Exactive质谱结果如下:
表1:手工操作和仪器操作后蛋白数及零漏切率对比
图1 Venn diagram(蓝色:手工;绿色:仪器)
试验总结
·手工操作和仪器操作蛋白样本预处理后可检测到的蛋白数及零漏切率基本一致,达到预期要求;
·手工操作与仪器操作蛋白种类皮尔斯相关系数大于0.97,与预期一致;
样本批间测试数据
图2 96孔板检测示意图
如图2所示共处理96个样品,分三组进行实验,随机选取36个样品进行Q Exactive质谱检测,结果如下:
图3 36个样本检测蛋白数(个)
图4 36个样本零漏切率(%)
图5 随机样品日间比较
实验总结
·36个随机样本检测蛋白数3074±89个,零漏切率78.32±2.66%,样本预处理的结果正常且稳定;
·36个样品的皮尔斯相关系数及日间随机样品皮尔斯相关系数均介于0.955-0.989之间,达到指标要求,具有较好的均一性。
应用领域 |
临床诊断/用药指导/病理机制研究/疾病标志物的发现/药物机理研究