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iTRAQ
iTRAQ技术原理:
iTRAQ试剂为可与氨基酸N端及赖氨酸侧链连接的胺标记同重元素(isobaric)。在质谱图中,任何一种iTRAQ试剂标记的不同样本中的同一蛋白质表现为相同的质荷比。
在串联质谱中,信号离子表现为不同质荷比(114~117)的峰,因此,根据波峰的高度及面积,可以得到蛋白质的定量信息。
技术特点:
1.可同时标记2~8 个样本。
2. iTRAQ技术不仅可发现胞浆蛋白,还有膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白。iTRAQ技术可检测出低丰度蛋白、强碱性蛋白、小于10KD或大于200KD的蛋白。
3.可标记修饰后的氨基酸,因此对磷酸化蛋白等翻译后修饰蛋白进行定性定量研究。
4.报告离子的相对分子质量较低(113~121),低分子量区是质谱定性(质量确定)和定量(丰度比较)较为准确的区域,因此质谱检测更为灵敏可靠。
iTRAQ试剂包括三部分:
1. 报告基团(reporter group):相对分子量为113-121Da(无120),因此iTRAQ试剂可同时标记8组样品。
2. 平衡基团(balance group):相对分子量为192-184Da (无185),使得八种iTRAQ试剂分子量均为305 Da,保证标记的同一肽段m/z相同。
3. 肽反应基团:能与肽段N端及赖氨酸侧链氨基发生共价连接,从而标记上肽段 拿到蛋白样品之后,不同组的样品首先分别进行等量酶切,每一个酶切得到的肽段样品选择一种标记试剂进行标记反应(每一个肽段至少含有一个游离的氨基进行反应);然后将经过不同标记的肽段样品混合后进行后续的质谱分析。
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高通量蛋白质组学/ iTRAQ 高通量蛋白质组学/ iTRAQ