Takara真香推荐—简便好用的液态活检解决方案之游离DNA篇
时间：2020-10-12 阅读：1107
| 在肿瘤早期筛查研究领域，循环肿瘤DNA（ctDNA）一直是各大厂商、科研工作者关注的重点。虽然ctDNA的应用日趋成熟，但总有一些微量的ctDNA样本无法用传统技术完成高品质文库的构建，特别是在进行肿瘤早期诊断有重要价值的稀有突变分析时。 如何以微量ctDNA起始构建可准确分析稀有突变的文库？Takara的解决方案是引入分子标签技术！ |
| ■ 微量ctDNA样本无法准确分析稀有变异? 自带1600万分子标签的建库技术了解一下 |
| ThruPLEX Tag-Seq Kit是Takara推出的采用茎环形接头，含1600万种分子标签的DNA-Seq文库构建技术，足以准确区分是测序错误还是真实的稀有突变！ |
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| 同时，该产品支持1-50 ng cfDNA起始，微量样本的文库构建不再是难题！ ThruPLEX单管操作、手动15 min、总共两小时，过程中无需转管与纯化，实验小白也能轻松上手！ |
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| ● 实验案例 |
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| 分别以10 ng及30 ng的cfDNA标准样品（Horizon Diagnostics）起始，使用ThruPLEX Tag-seq kit制备文库，然后使用Agilent SureSelect靶向序列富集系统定制Panel(110 KB)，或Roche的NimbleGen SeqCap EZ定制Panel（240 KB）进行富集，使用illumina的NGS平台进行测序。得到的数据使用Curio（Curio Genomics）分析。 |
| 使用Agilent (30 ng DNA input)或Roche（10 ng DNA input）两者中的任意一个靶向富集系统时，可以得到与已知的MAF（Minor Allele Frequency）同等的结果。 |
| （数据来源于Takara Bio USA, Inc.） |
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| ● 实验友好型的ctDNA稀有突变分析方案 |
| 可能有些刚开展ctDNA稀有变异分析项目的朋友会有所担心，即便能简便快捷地构建NGS文库，但后期如果没有易用的生信分析流程，一样会成为项目研发的阻碍。 |
| No Worries！以下三款生信分析工具，搭配ThruPLEX Tag-Seq使用，效果更佳！ |
Connor：GitHub平台上一款开放型的生信工具，可以处理ThruPLEX Tag-Seq文库的测序数据。Connor可以aligned BAM文件作为输入量，分析分子标签信息，并生成含对应序列的BAM文件，后续可结合突变分析软件进行分析，如FreeBayes等。
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