气相色谱仪是以气体作为流动相（载气）。当样品由微量注射器“注射”进入进样器后，被载气携带进入填充柱或毛细管色谱柱。由于样品中各组分在色谱柱中的流动相（气相）和固定相（液相或固相）间分配或吸附系数的差异，在载气的冲洗下，各组分在两相间作反复多次分配使各组分在柱中得到分离，然后用接在柱后的检测器根据组分的物理化学特性将各组分按顺序检测出来。

色谱柱污染会出现哪些现象：

1.如果色谱柱是毛细柱，则将进样口端截去15cm左右；如果是填充柱，卸下进样口端，检查填充柱内的石英棉是否有明显污染的痕迹。色谱柱检查完后进行高温老化，温度设定在高于使用温度30～50℃以上，如果超出允许使用温度，则设定在最高使用温度以下10℃。设定合适的程序升温方法，老化3～5个小时。进样口清洗后污染仍然不能解决，可以使用溶剂清洗色谱柱的方法。因为溶剂清洗色谱柱需要专用工具，操作也不简单，有条件的话更换一根正常的色谱柱也是快速排除色谱柱是否污染的方法。

2.更换新的进样垫、气化衬管，进样口温度升高30～50℃。分析样品后如果仍出现相同的杂峰，进行下一步。