生物反应器经历了三个发展阶段：细菌基因工程、细胞基因工程、转基因动物生物反应器。转基因动物生物反应器的出现之所以受到人们的关注，是因为它克服了前两者的缺陷，即细菌基因工程产物往往不具备生物活性，必须经过糖基化、羟基化等一系列修饰加工后才能成为有效的药物，而细胞基因工程又因为哺乳动物细胞的培养条件要求相当苛刻、成本太高而限制了规模生产。
 

　　另外，转基因动物生物反应器还具有产品质量高、容易提纯的特点。一般把目的片段在器官或组织中表达的转基因动物叫做动物生物反应器。几乎任何有生命的器官、组织或其中一部分都可以经过人为驯化为生物反应器。从生产的角度考虑，生物反应器选择的组织或器官要方便产物的获得，例如乳腺、膀胱、血液等，由此发展了动物乳腺生物反应器、动物血液生物反应器和动物膀胱生物反应器等。其中，转基因动物乳腺生物反应器的研究引人注目。
 

　　生物反应器在生物制药中的应用及现状：
 

　　21世纪初，随着流加培养、灌流培养、基因工程等技术的发展，作为大规模培养主要设备的生物反应器规模也趋向大型化和自动化。当前生物制药的主流技术是在大型机械搅拌式反应器中，用无血清培养基和灌流工艺悬浮培养细胞进行生产。
 

　　生物反应器大规模培养在生物制药领域快速发展，全球销售额zui高的6大类生物技术药中，5类是经哺乳动物细胞表达生产的。现代基因工程技术及生物反应器工艺的发展，促进细胞培养制药的快速发展。纷纷进行细胞改造筛选，发展自己的细胞培养平台。反观国内，人用和兽用疫苗企业超过120家，应用生物反应器进行生产的大多还是小规模的试验阶段，与国外万升级规模相比还较大的差距。