Rubicon Genomics测序文库(illumina平台)
时间:2018-03-30 阅读:2226
Rubicon拥有ThruPLEX®和PicoPLEX®技术。特殊的引物或接头设计,能以微量DNA样本起始构建下一代测序文库。
ThruPLEX
Rubicon ThruPLEX和所有illumina NGS平台兼容。ThruPLEX DNA-seq Kit是通用性较高的试剂盒,适合全基因组测序、全外显子测序、靶向测序和ChIP-Seq的文库构建。
ThruPLEX Plasma-seq是血浆游离DNA的试剂盒,适用液体活检相关(循环肿瘤DNA和无创产前检测:母体血浆胎儿游离DNA)的基因文库构建。
ThruPLEX Tag-seq Kit能提供1600万以上的分子标签(Unique Molecular Tags),结合靶向序列富集系统,适合稀有变异等位基因检测。
PicoPLEX
Rubicon PicoPLEX 采用技术,设计优化用于从单细胞中扩增全基因组DNA,适用植入前胚胎基因筛查和诊断(PGS,PGD)。
PicoPLEX WGA Kit不能直接应用NGS,PicoPLEX DNA-seq Kit可以直接应用illumina NGS平台。
Rubicon ThruPLEX®和PicoPLEX®两种技术都有*的自配对茎环形DNA fragment,能减少基因扩增时假阳性、假阴性和非特异性扩增的发生。
单细胞文库构建-Rubicon
更高的通量, 更好的性能, 用于所有 Illumina® 的 NGS 平台
更高的通量–多达 96 个 index
微量起始样品(50 pg – 50 ng),更高性能
快速简单的实验方法:一根管或孔中,仅三步反应,约 2 小时时间,无需转移
适用于所有主要的靶向富集平台–安捷伦 SureSelect® Enrichment,罗氏 NimbleGen® SeqCap EZ®,IDT xGEN® LockDown® probes
专为血浆游离DNA设计
专为cfDNA设计:修复及连接试剂配方更新,方法优化
高品质NGS文库:在宽广的GC含量范围内,可以达到高检测再现性
起始量范围广:<1 ng到30 ng cfDNA量
快速简便:单管、2小时、3步操作步骤,无需纯化或样品转移步骤
应用领域:液体活检、ctDNA、靶向测序等领域文库构建
兼容自动化平台:Beckman® FXP Workstation
设计用于靶向序列的超深度测序
可信赖的实验结果。ThruPLEX Tag-seq技术提供了多达1,600万个分子标签来纠正测序误差,提供可信的变异检测分析。
发现更多,成本更低。结合基于杂交技术的目标序列富集系统可分析数百个基因,同时分析突变和结构变异。
每次都可获得高质量文库。单管操作,2小时,3步操作流程。使用简便,可减少使用者操作误差和污染发生。
省时的生物信息学分析方案。采用Curio Genomics提供的云服务软件或开源软件可以快速获得研究结果。
珍贵样品分析成为可能。更低的DNA起始量,以往由于起始量太低而不能分析的样品也可以分析了。ThruPLEX Tag-seq可以1 ng至50 ng cfDNA或片段化的dsDNA起始,兼容多种样品类型。
ThruPLEX系列型号选择
试剂盒 | 应用 | 特点 | 样品 |
ThruPLEX® DNA-seq | 通用DNA扩增试剂盒。应用范围广。文献常见应用:ChIP-Seq。 | 有多种索引选择。 | 50pg-50ng gDNA、cDNA、FFPE DNA、ChIP DNA |
ThruPLEX® Plasma-seq | 肿瘤或其他疾病无创检测,母体血浆中胎儿游离DNA分析 | 优化了模版修复和文库合成步骤,适用血浆游离DNA(短又变性的DNA fragment)。
| 血浆、尿液、液体活检1ng-30ng cell-free DNA |
ThruPLEX® Tag-seq | 肿瘤或其他疾病中稀有变异等位基因检测。 | 茎环形接头包含了分子标签连接DNA fragment两端。
| 1ng-50ng gDNA、cell-free DNA、FFPE DNA |
单细胞 DNA 文库制备技术,适用于 Illumina 所有 NGS 测序平台
•减少歧义-可高度重复性地检测基因组拷贝数变异(CNV)和非整倍性
•减少工作流程-从一个单细胞到制备 DNA 测序文库仅仅三个步骤
•降低成本-单一试剂盒包含制备一个测序文库所需要的所有材料
•减少污染和错误-在一个单一的管或孔中完成文库制备所有流程,不需要转移 DNA 样品
•减少反应时间- 制备 Illumina NGS 文库不到3个小时
用于单细胞文库构建的全基因组扩增解决方案
•单细胞研究结果可高度重复(或 <15 pg DNA )
•再现性良好的等位基因显示
•易于使用和高度自动化
•在所有分辨率下,结果清晰
Rubicon 试剂订购信息
品牌 | 货号 | 新货号 | 产品描述 | 包装 |
Rubicon | RB4406 | R400406 | ThruPLEX DNA-seq 48D Kit ThruPLEX通用文库构建试剂盒 | 48Rxns |
Rubicon | RB4407 | R400407 | ThruPLEX DNA-seq 96D Kit ThruPLEX通用文库构建试剂盒 | 96Rxns |
Rubicon | RB4427 | R400427 | ThruPLEX DNA-seq 48S Kit ThruPLEX通用文库构建试剂盒 | 48Rxns |
Rubicon | RB4428 | R400428 | ThruPLEX DNA-seq 12S (48)Kit ThruPLEX通用文库构建试剂盒 | 48Rxns |
Rubicon | RB4523 | R400523 | ThruPLEX DNA-seq 6S (12 )Kit ThruPLEX通用文库构建试剂盒 | 12Rxns |
Rubicon | RB4490 | R400490 | ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit ThruPLEX血浆测序试剂盒 | 12Rxns |
Rubicon | RB4491 | R400491 | ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit ThruPLEX血浆测序试剂盒 | 48Rxns |
Rubicon | RB4492 | R400492 | ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit ThruPLEX血浆测序试剂盒 | 96Rxns |
Rubicon | RB4584 | R400584 | ThruPLEX Tag-seq 6S(12)Kit | 12Rxns |
Rubicon | RB4585 | R400585 | SMARTer® ThruPLEX® Tag-seq 48S Kit | 48Rxns |
Rubicon | RB4586 | R400586 | SMARTer® ThruPLEX® Tag-seq 96D Kit | 96Rxns |
Rubicon | RB3050 | R30050 | PicoPLEX WGA Kit,array CGH、PCR分析用 | 50Rxns |
Rubicon | RB3381 | R300381 | PicoPLEX DNA-seq Kit,48种双端illumina indexes | 48Rxns |
Rubicon公司成立于2000年,总部位于美国密歇根州。产品都拥有技术,检控严格,拥有cGMP级生产能力,是单细胞测序文库构建的。2017年1月,Rubicon 成为Takara的一员,并且发展良好。
华雅旗下红荣微再(上海)生物工程技术有限公司2018年,与TAKARA继续合作,授权代理(上海)Rubicon和Cellartis 试剂。红荣微再以“传递科学价值,服务科学研究”为宗旨,主营干细胞、医疗、细胞治疗、器官再生四大板块的产品。
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