单细胞全基因组扩增WGA技术PicoPLEX与MALBAC比较
时间：2018-03-30 阅读：6255
关键词：单细胞全基因组扩增技术WGA，PicoPLEX 特殊随机引物起始的热循环扩增，MALBAC Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles （多次退火环状循环扩增技术）
PicoPLEX与MALBAC的区别
申请情况
Rubicon : US8206913 Filed Date : Mar 3, 2010
MALBAC : WO2012/166425 International filing date : 22 May, 2012
主要区别
（1）MALBAC的细胞裂解时间更长。
MALBAC：30 min
PicoPLEX：15 min
（2）引物设计不同，PicoPLEX的结果更准确、重复性更高，更适合用于染色体异倍性分析和拷贝数变异分析。
MALBAC和PicoPLEX技术介绍
MALBAC 多次退火环状循环扩增技术
PicoPLEX 特殊随机引物起始的热循环扩增+PCR
MALBAC：Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles （多次退火环状循环扩增技术）是一种拟线性全基因组扩增方法。与传统的非线性或指数型DNA扩增方法不同（在每个循环中，复制的DNA可以作为后续循环的模板），MALBAC利用特殊的引物使扩增子具有互补末端并因此循环，防止DNA被指数复制。这导致仅扩增原始基因组DNA，并因此降低扩增偏倚。
PicoPLEX单细胞全基因组扩增WGA技术是一种特殊随机引物起始的热循环扩增+PCR的全基因组扩增方法。PicoPLEX相比于以往的PCR、MDA、MALBC为基础的单细胞全基因组扩增技术，操作简单快速。PicoPLEX全基因组扩增技术具有高稳定性和可再现性，已经成为PGS的标准扩增技术。这一技术也适用任何单细胞样品和皮克级纯化DNA的基因特征分析。
PicoPLEX 技术流程：
包括文库构建和文库扩增两个步骤。文库构建（预扩增）阶段，设计的特殊引物能消除引物之间的杂交，从而提高引物和模板的配对效率。利用特殊随机引物（Quasi-random primer）引发线性扩增进行全基因组扩增。特别设计的随机引物（参见US patent 8,206,913）能减少引物二聚体的形成，从而提高引物和模板的配对效率。
分两次扩增。*次扩增，特殊随机引物与基因组DNA结合，形成茎环形结构文库，第二次扩增，只有茎环形结构的文库被扩增。
PicoPLEX产品引用文献
PicoPLEX WGA kit采用PicoPLEX技术，设计、优化用于从单细胞中扩增单拷贝基因组DNA。
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