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面议RubiconGenomics ThruPLEX Plasma测序试剂盒
ThruPLEX® Plasma-seq Kit
Illumina® NGS library preparation for cell-free DNA
用于无细胞DNA的Illumina NGS制备
RubiconGenomics ThruPLEX Plasma测序试剂盒
为无细胞DNA设计---新配制的修复和连接试剂。
高性能的NGS文库---文库多样性,样本输入量少,有更宽的和可重复的GC覆盖范围。
适应的样本输入量--<1-30mg的无细胞的DNA.
快速便捷的操作---在单个管或孔中,三步完成,2个小时,无需纯化或者样本转移步骤。
美国Rubicon Genomics R30050 PicoPLEX:trademark: WGA kit 50 rxn 现货供应
美国Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn 现货供应
美国Rubicon Genomics R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12 rxn 现货供应
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多样性zui高,zui少的未映射的无细胞DNA读取
优秀的靶向序列捕获Peformance
重现性好,无偏GC覆盖
卡罗林斯卡研究所CRUK评估
ThruPLEX等离子-SEQ套件单管工作流程
多样性zui高,zui少的未映射的无细胞DNA读取
具有很高的多样性和低数量的重复和未映射ThruPLEX等离子-SEQ套件产生质量库读取。无细胞DNA从3血浆样品中提取,并在如由Qubit®测定中所示的量制备的库。 mononucleosomal的DNA各样品中作为由Bioanalyzer®测量的量对应于0.09纳克,0.62纳克,和15.44毫微克。汇集库进行测序上的IlluminaNextSeq®500与17M 25M到一个配对末端运行每个库读取,复制计算率后的数据降采样,以17米每库读取。
优秀的靶向序列捕获Peformance
ThruPLEX等离子体SEQ套件文库以高效率捕获并与激酶组用于突变检测的深覆盖所产生的数据。在5毫微克,6.5纳克,一式三份10毫微克的操作量从3血浆样品制备的库,和有针对性的测序使用与ClearSeq人类DNA激酶组小组SureSelectXT2丰富的样品进行了上Illumina的MiSeq。平均而言,5M分别读取每个库生成的。选择的基地被成功抓获那名中或毒饵250 bp的内基地
美国Rubicon Genomics R30050 PicoPLEX:trademark: WGA kit 50 rxn 现货供应
美国Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn 现货供应
美国Rubicon Genomics R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12 rxn 现货供应
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重现性好,无偏GC覆盖
ThruPLEX等离子-SEQ套件在整个人类基因组提供了zui可重复的和公正的GC覆盖。 ThruPLEX库显示zui小变异横跨9个人的血浆样本进行测试。文库从1毫升血浆样品的分离和测序上的Illumina NextSeq 500四个单独的血浆样品无细胞的DNA制备的用于构建NEBNext超库。
卡罗林斯卡研究所CRUK评估
Illumina公司NGS库用5纳克使用ThruPLEX等离子体SEQ套件收集的血浆样品中分离的无细胞的DNA的制备。低通WGS是在HiSeq进行大约12.5M每个库的读取。 (Karolinska研究所,瑞典的数据提供)。
ThruPLEX等离子-SEQ套件单管工作流程
ThruPLEX等离子-SEQ套件单管工作流程
1至30毫微克无细胞DNA的开始,ThruPLEX等离子-SEQ套件创建了3个简单的步骤索引库:末端修复,接头连接,以及高保真库放大。不需要净化或样品转移步骤。流线型的工作流程在2个小时的单管或表现良好,防止样品的损失,提高阳性样品鉴定。
ThruPLEX等离子-SEQ套件技术
ThruPLEX等离子-SEQ套件技术
ThruPLEX等离子体SEQ套件技术是为无细胞的DNA进行了优化的3步反应。无细胞的DNA(1ng至30毫微克)首先在一高效率的处理修复。背景是使用无单链尾双链适配器减小。平端连接具有高效率的发生。阻止5'端减少适配器适配器连接。背景由结扎后破坏未使用的适配器进一步降低。高保真扩增完成反应,生成索引Illumina的图书馆。
Ordering Information
CAT. NO. R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit (12 reactions, 12 single indexes)
CAT. NO. R400491 ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit (48 reactions, 48 single indexes)
CAT. NO. R400492 ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit (96 reactions, 96 dual indexes)
美国Rubicon Genomics R30050 PicoPLEX:trademark: WGA kit 50 rxn 现货供应
美国Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn 现货供应
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设计用于无细胞的DNA:新制定维修和连接试剂具有优化的协议
高性能NGS库:具有广泛和可重复的GC覆盖高度多样性
可变采样输入:<1毫微克至30毫微克无细胞的DNA
快速简单的工作流程:在单管3步,或同时在2个小时,没有净化或样品转移步骤
研究应用:从库样本,其中结果需要高灵敏度,包括液体活检,叶绿体DNA,并有针对性测序
自动化友好:Beckman®FXP工作站
在恒温冷冻保证了9个月,在-20℃。
储存于-20℃。
常见问题解答
1.什么类型的样品和投入可以用等离子ThruPLEX-SEQ使用?
ThruPLEX等离子体SEQ套件被设计为从血浆中分离的无细胞的DNA产生的Illumina NGS DNA文库。所述ThruPLEX等离子体SEQ化学被改写,以产生多样库具有广泛的GC覆盖,从无细胞的DNA的1至30毫微克*提供重现的测序结果。
应用程序的输入样本类型推荐的输入量
从等离子和液体活检DNA测序;叶绿体DNA分析,从血浆中1纳克孤立的目标序列无细胞DNA - 30纳克*
*库已经从输入产生量低于1纳克和超过30纳克。
以获取进一步的信息。
2.什么是ThruPLEX的DNA序列套件和新ThruPLEX等离子体序列包之间的主要技术差异?
ThruPLEX等离子体SEQ套件已经用于从血浆中分离无细胞的DNA进行了优化。
剪切或无细胞的DNA片段化是没有必要与ThruPLEX等离子体以次套件。
的协议是不同的(见下文)。
3.什么是ThruPLEX等离子体序列和ThruPLEX的DNA序列之间的协议差异?
模板制备步骤:卷和保温温度
库合成步骤:卷和孵化温度
库扩增步骤:卷和扩增循环数
4.可从血浆ThruPLEX-SEQ试剂与ThruPLEX的DNA序列试剂互换?
不,ThruPLEX等离子-SEQ套件内容不与其他人Rubicon基因组学产品互换。
美国Rubicon Genomics R30050 PicoPLEX:trademark: WGA kit 50 rxn 现货供应
美国Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn 现货供应
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5.什么索引类型或条形码,你有可用?
ThruPLEX等离子体SEQ 12S和48S套件中提供的管分配Illumina的兼容8NT单个索引或96孔板中。这些指数序列是由威康信托基金会桑格研究所在英国剑桥的发展。关于桑格指数序列的信息可以在自然的方法可以找到7,111-118(2010)。
ThruPLEX等离子体SEQ 96D套件设置有Illumina公司TruSeq HT i5和在96孔板分配i7双索引。在i5指标有Illumina的D501 D508到序列,和I7指标有D701到D712序列。
有关索引的详细信息,请参阅附录1的等离子ThruPLEX-SEQ套件说明手册中的
6.你对隔离血浆中游离DNA有什么建议?
ThruPLEX等离子序列与游离DNA进行了优化使用循环QIAamp®核酸试剂盒(Qiagen,目录55114号)编制。
Tris和EDTA的在包含输入DNA中的缓冲器中的浓度必须不超过10毫和0.1mM分别。避免含磷酸盐缓冲液。
7.什么样的收集管我应该用从受试者抽血?
在卢比肯基因组学科研人员使用与K2 EDTA真空管静脉管采集的血液(Becton Dickinson公司,货号36643)。
9.从尿或其他生物液体隔离式CAN细胞游离DNA与ThruPLEX等离子-SEQ套件使用?
ThruPLEX等离子体以次用从人血浆中分离无细胞的DNA进行了优化;然而,该试剂盒可以与来自其他生物流体降解的DNA的工作。从其它样品来源无细胞的DNA必须首先用DNA提取/纯化试剂盒提取。由于这些来源的游离DNA正常降解/零散,不成附加是不必要的。每个反应输入无细胞DNA的量必须不超过10微升。
10.与任何靶向序列捕获系统兼容ThruPLEX等离子-SEQ套件?
是的,ThruPLEX等离子-SEQ套件与各大外显子组和靶向富集产品,包括安捷伦SureSelect®,罗氏NimbleGen®SeqCap®EZ和自定义面板兼容。
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