內溶素的克隆、诱导表达与纯化
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作为噬菌体衍生的酶,内溶素本质是一种蛋白分子,其通过分解细菌细胞壁的肽聚糖成分,帮助噬菌体颗粒从细菌宿主释放,可在噬菌体复制过程中表达,破坏细菌细胞壁肽聚糖的关键化学键。
原理
通过内溶素的蛋白表达、纯化能够将内溶素基因克隆到表达载体(如 pET28a),进一步转化大肠杆菌进行扩增,重组质粒经 IPTG 诱导表达,得到经镍柱纯化的内溶素蛋白。
用途
为治疗抗生素耐药的细菌感染提供潜在解决方案。
材料与仪器
仪器:
离心机、超声破碎仪
恒温摇床、恒温培养箱、PCR 仪、电泳仪
凝胶扫描仪、镍柱纯化系统、0.22 μm 滤膜
试剂:
质粒提取试剂盒、胶回收试剂盒
核酸内切酶、T4 连接酶、Pfu 聚合酶
IPTG、考马斯亮蓝
步骤
1、引物设计:对待研究的内溶素完成基因组测序注释工作,根据已测基因组进行引物设计 P1 与 P2,并引入酶切位点。
2、PCR 扩增内溶素基因:反应体系与程序见表 1。
3、PCR 反应条件:95 ℃ 预变性 5 min,95 ℃ 变性 30 s,Tm 温度下退火30 s,72 ℃ 延伸 30 s,共 30 个循环,72 ℃ 最后延伸 10 min,26 ℃ 再反应 2 min(终止反应)。
4、回收 PCR 产物胶:进行琼脂糖凝胶电泳,将 50 μL 全部上样,切下目的基因条带,使用胶回收试剂盒回收目的基因(一般实验室都会有常用品牌)。
5、抽提质粒:使用质粒抽提试剂盒抽提载体质粒(一般实验室都会有常用品牌)。
6、对位点进行酶切:利用一开始设计好的酶切位点对载体与目的基因进行双酶切,在 37 ℃ 下反应 3 h。
7、切胶回收:将酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳,切取含 DNA 片段的目的条带并进行回收,得到 DNA 后检测其浓度并保存在 -20 ℃ 冰箱备用。
8、DNA 与载体连接:用 T4 连接酶连接载体与 DNA 片段,在 16 ℃ 下过夜。
9、转化大肠杆菌:取 50 μL 大肠杆菌 BL21 感受态细胞,加入 5 μL 连接液后冰上孵育 30 min,摇匀后 42 ℃ 水浴热休克 90 s,然后迅速冰浴 2 min,冰浴后再加入已经预热的 1 mL LB 培养基,37 ℃ 摇床震荡 1 h 复苏,最后涂板至卡那霉素抗性的平板,37 ℃ 温度下培养过夜。次日挑取单菌落进行菌落 PCR,将阳性菌落接种于培养基中 37 ℃ 温度下培养过夜。
10、抽提质粒并进行双酶切验证(参见 5、6 步)。
1、少量诱导表达:挑选单菌落过夜培养,过夜菌接种至 1 mL 培养基,37 ℃ 培养 2~3 h,再加入 10 μL 0.1 M 的 IPTG 在 16 ℃ 诱导 4 h,取 20 μL 菌液加入 7.5 μL 的蛋白缓冲上样液,100 ℃ 沸水煮 10 min 后电泳,倒入考马斯亮蓝过夜震荡,清洗后寻找发现目标蛋白条带存在,进一步扩大培养。
2、扩大培养:将阳性菌落涂布平板过夜,挑选单菌落接种至 10 mL 培养基,37 ℃ 培养 6 h,按 1:100 比例接种于 500 mL 培养液中,37 ℃ 摇床至 OD600 值为 0.6~0.8,加入终浓度为 1 mM 的 IPTG 诱导剂,在 16 ℃ 下继续培养 12 h。
3、细胞破碎:菌液离心 10 min(4000 g,4 ℃),重悬于 30 mL PBS,加入 PMSF 和 tritonX-100 冰浴 1 h 后超声破碎,破碎菌液在 4 ℃ 转入 50 mL 离心管,12000 rpm 离心10 min,取上清液用 0.22 μm 滤膜过滤杂质。
4、蛋白纯化:采用 Ni-NTA 纯化系统进行镍柱亲和层析纯化目的蛋白,纯化后跑电泳,分析蛋白纯度。
注意事项
1. PCR 条件与程序需要根据实验进行梯度摸索。
2. T4 连接酶在高温不稳定,通常 16 ℃ 连接过夜,在 25 ℃ 左右的室温能维持七八个小时。
常见问题
蛋白诱导表达效果不好(蛋白诱导表达条件并不一定适用所有实验室,需要自己做实验摸索条件)。
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