近些年来，XRM技术开始逐渐广泛应用于土壤学和植物科学，研究土壤性质、土壤微生物对土壤性质的影响、植物根发育及其内部结构、内部养分运输机制等等。而随着发展的深入，目前XRM技术也开始被应用于植物地上结构的研究中。 

实例一

木材内部多孔结构及木质部导管表征，Bruker Skyscan 1273, 7um.

木材内部多孔结构正交三视图及局部放大表征

木材内部整体结构三维表征（左图） 木材木质部导管三维分布表征（右图）

实例二

土壤内部孔隙结构三维表征及定量分析，Bruker Skyscan1275，15um.

土壤样品 （压实），20mm x 20mm x 20mm（左图）  土壤样品整体三维结构（右图）

内部孔隙（蓝）结构三维分布（左图） 内部孔隙结构的孔径分布三维表征（右图）

实例三

水稻根茎及内部维管束三维模型建立，Skyscan1272，4um（20%碘化铯溶液，8H）.

水稻根茎正交三视图

水稻根茎整体形貌三维表征（左图） 水稻根茎内维管束（红）三维表征（右图）