Chromatin Isolation via RNA Precipitation

Chromatin Isolation via RNA Precipitation

基本信息

ChIRP是一种快速技术，可发现与RNA相关的DNA序列，并以高灵敏度和低背景定位与染色质相关的长非编码RNA（lncRNA）的基因组结合位点.

通过这种方法，您可以定位哪些染色质区域在一起进行协调表达，确定哪些基因一起表达，并了解lncRNA在染色质调节中的作用。使用我们的ChIRP探针设计者设计的反义寡核苷酸捕获目标lncRNA的亲和力，并对与lncRNA相关的DNA染色质进行测序以创建测序文库。利用DNA序列数据，可以生成几百个碱基分辨率的基因组结合位点图。ChIRP是一种快速技术，可发现与RNA相关的DNA序列，并以高灵敏度和低背景定位与染色质相关的长非编码RNA（lncRNA）的基因组结合位点。通过这种方法，您可以定位哪些染色质区域在一起进行协调表达，确定哪些基因一起表达，并了解lncRNA在染色质调节中的作用。使用我们的ChIRP探针设计者设计的反义寡核苷酸捕获目标lncRNA的亲和力，并对与lncRNA相关的DNA染色质进行测序以创建测序文库。利用DNA序列数据，可以生成几百个碱基分辨率的基因组结合位点图。

ChIRP寡核苷酸集可在LGC Biosearch的基于Web的设计师中进行设计并直接订购。寡核苷酸以每孔5 nmol每个寡核苷酸的平板形式交付，因此可以将它们组合成合适的组。我们建议每组使用8至48个寡核苷酸。我们使用的连接子是C3（生物素）；3'修改与初使用的修改不同，但已被该技术的发起者批准。完整的ChIRP方法的缓冲液和其他试剂由EMD / Millipore提供。