临床实验室工作的研究对象是具有潜在感染性的人或动物的血液、体液、分泌物和排泄物等样本，这些样本极可能存在大量的病原微生物并通过实验过程中的离心、振荡、搅拌、灼烧等实验操作，形成气溶胶、泼洒、溅出、直接接触而污染实验室，通过呼吸道、接触传染等方式感染人或动物。临床实验室的消毒与灭菌是采用物理和化学等方法来抑制或杀灭实验室空气、地面、物表、实验器材、实验仪器和工作人员体表等上的病原微生物，防止传染病的发生、医院内感染或社区内感染。

1．消毒

消毒是指杀灭或清除传播媒介上的病原微生物，使之达到无害化的处理。

根据有无已知的传染源可分预防性消毒和疫源性消毒；在没有明确的传染源存在，也未发现传染病的情况下，对可能受到病原微生物或其它有害微生物污染的场所和物品进行消毒，称为预防性消毒。对存在或曾经存在污染源的场所进行消毒，其目的是杀灭或清除传染源排出的病原体，称为疫源性消毒。

根据消毒剂的效果，消毒剂又包括消毒剂：可杀灭各种微生物（包括细菌芽孢）的消毒剂，如含戊二醛、过氧乙酸、含氯消毒剂[漂白粉、次氯酸钠、次氯酸钙（漂粉精）、二氯异氰尿酸钠（优氯净）、三氯异氰尿酸]等；中效消毒剂：可杀灭各种细菌繁殖体（包括结核杆菌），以及多数病毒、真菌，但不能杀灭细菌芽孢的消毒剂，如含碘消毒剂（碘伏、碘酊）、醇类及其复配消毒剂、酚类消毒剂等；低效消毒剂：可杀灭细菌繁殖体和亲脂病毒的消毒剂。如苯扎溴铵（苯扎氯铵）等季铵盐类消毒剂，醋酸氯已定（或葡萄糖酸氯己定）等双胍类消毒剂等。

根据消毒的时间可分为随时消毒和终末消毒。

常用的消毒方法有化学消毒（如使用甲醛、酒精等）和物理消毒（如使用紫外灯、高压蒸汽灭菌器、焚烧等）。

2．灭菌

灭菌是指杀灭或清除传播媒介上一切微生物，使之达到无菌程度的过程称为灭菌。通常用物理方法达到灭菌效果，如高压蒸汽灭菌、干烤灭菌等。

消毒与灭菌是两个不同的概念。灭菌可包括消毒，而消毒却不能代替灭菌。消毒多用于卫生防疫方面，灭菌则主要用于医疗护理。