医院污水按污染物不同大致可分为病原性微生物污染污水、有毒有害化学污水、放射性污染物污染废污水三类。

1、病原性微生物及其控制指标

通常把大肠菌群数和粪大肠菌群数作为衡量水质受到粪便污染的生物学指标。医院污水和生活污水中经水传播的疾病主要是肠道疾病，由病毒传播的疾病有肝炎、小儿麻痹等。

2、有毒有害物质及水质指标

PH：医院的酸碱污水主要来自化验室、检验室的消毒剂的使用及洗衣房和放射科等，可对管道造成腐蚀或影响消毒剂的使用效果。

 SS：影响水体外观和氯化消毒灭活效果。

BOD和COD：大部分来自生活系统排水，可生化性能良好，但医院广泛使用的消毒剂对生物处理是不利的。

动植物油：来自食堂排水，影响水体溶解氧和医院含菌污水的消毒效果。

总汞：包含有机、无机、可溶和悬浮的汞，可使人体发生全身性中毒。

3、放射性同位素水质指标

医院单位在诊断和治疗中用到的放射性同位素在其衰变过程中产生α、β、γ放射性，在人体内积累会对人体健康造成损害。医院放射性污水主要来自同位素治疗室，应针对这一部分污水单独设置衰变池处理，达标后再排入综合下水道。