仪器系统发生故障是指该仪器系统的一些性能偏离了出厂设计指标，或是由于各种原因系统停止工作。因为仪器系统的指标往往不止是单独几项，经常是密切关联的多项指标，要证明仪器系统是否存在故障，必须依据出厂指标或是*的技术指标与实验方法进行检验。

    凡不能够按照仪器系统检验程序或试验方法进行或检验结果达不到设计要求的都可称为仪器系统发生了故障。不同的是这些故障有严重与轻微之分，对使用的影响各异。另外需要强调的是检验方法是要得到社会认可的，例如：国内通行、*的有关仪器的实验方法、国家检定规程与校准规范、环境试验条件、有关国家或标准以及各厂家商提供的检验方法。

      一般而言，色谱仪器的实验方法分为总则、主机性能试验、检测器性能试验和环境性能试验等。在相关的试验方法中，明确规定了仪器系统的各项指标测试方法以及合格与否的判断依据。在使用中还需注意由于用户与生产厂家的角度不同，对于一些可能的问题有时会有理解上的分歧。色谱仪器发生故障时需要进行检修或故障排除，检修人员要依照一定的程序对于仪器进行一系列诊断测试。该测试过程一直延续到故障原因被发现，并采取正确的故障排除措施。在诊断测试整个过程中，所有按次序排列的诊断语言的集合被称为故障诊断对策。