气相色谱柱是气相色谱仪的核心部件之一。而相对于填充柱来说，毛细管柱一般具有更高的分离效能，原因如下。
    1毛细管柱内径较小，一般为0.1~0.7mm，内壁固定液膜极薄，中心是空的，故阻力很小，而且涡流扩散项不存在，谱带展宽变小。由于毛细管柱的阻力很小，其长度可为填充柱的几十倍，其总柱效比填充柱高得多。一般来说，一根30m长的毛细管柱很容易达到100000的总理伦塔板数，而一根3m长的填充柱却zui多只有4500的总柱效。
    2毛细管柱的分析速度约为填充柱的数十倍。由于液膜极薄，分配比很小、相比大，组分在固定相中的传质速度极快，因此有利于提高柱效和分析速度。它可以再1h内分离出包含100多种化合物的汽油成分；可在 几分钟内分离十几种化合物。所以毛细管柱对于复杂的样品分离更有利，如农产品中的农药残留同时检测、环境样品的有机物污染检测、化妆品中香精检测等。
    当然，毛细管柱也有其局限性。因其内径小、柱容量小，且对进样技术的要求更高，载气流速的控制要求更为。进样量越小，意味着对检测器的灵敏度要求更高。所以考虑到分析工作中成本和经济效益，在进行简单的*性气体分析和低分子量有机化合物时，建议采用填充气相色谱柱。