当气相色谱仪仅有载气经过检测器时，色谱图上记录的曲线叫做基线。色谱分析中把基线在短时间内的波动叫做“噪声”。

影响基线噪声的因素很多，如检测器性能、载气纯度、色谱柱污染程度、样品纯度等。

当基线噪声不正常，若比正常值高10倍以上时，应先从气体、检测器其等方面查找原因；若仅仅比正常值高出不多时，应从色谱柱、衬管、样品纯度等方面查找原因。

1检查载气纯度是否达到仪器要求，载气纯度不够，基线噪声会比正常值大几十倍甚至百倍；气相对各种气体的纯度要求很高，这是因为气体的杂质会使得检测器的噪声增大，还可能对色谱柱性能有影响。

2检查检测器温度，检测器温度的设置原则是保证流出色谱柱的组分不会冷凝，同时满足检测器灵敏度的要求。

3检查进样口衬管，观察衬管里是否有黄色或者黑色异物，或者通过色谱图来判断衬管是否变脏；如果衬管内有污染物，它会吸附极性样品组分而造成峰拖尾，甚至峰分裂，还会出现鬼峰。

4检查色谱柱插入检测器的深度是否符合安装要求；不同色谱柱插入检测器的深度有不同的规定，应严格按仪器说明书确定。

5检查色谱柱是否污染或者柱流失，首先注意色谱峰形是否拖尾，如拖尾则应减少进样量或者稀释样品浓度，以免色谱柱过载。

6基线噪声是在不进样品或者走空白样品时的基线大小，它在数值上是zui小检测限的2倍。不同仪器、不同操作条件，他们的基线噪声是不一样的。样品进度后基线噪声较大，可在进样后用溶剂进行清洗系统。

7如以上方法均不能解决问题，则检测器被污染，可高温烘烤或者溶剂清洗检测器除去污染物。