室温较高时，使用纯水相或有机相比例较低时，流动相应临用现配及时清洗吸滤头以防吸滤头堵塞。

定期检查溶剂过滤头，尤其是水及相似溶剂作为流动相时，细菌等微生物及其代谢产物容易沉淀堵塞滤头。

所以定期更换溶剂，并在清洁溶剂瓶后重新装入新的溶剂，必要时，更换新的溶剂滤头。 

泵的易损件主要为单向阀、过滤白头、柱塞杆、柱塞密封圈等，做好泵头的维护，反相系统使用缓冲盐时应使用seal wash清洗，如没有自动后密封清洗系统，可以手动清洗，当使用正相系统时选择适宜的溶剂清洗。

应注意有些品牌的后密封清洗系统的溶剂瓶是循环的，有些品牌是非循环利用的，对于循环式的后密封清洗系统应定期更换储液瓶中的溶剂，避免溶剂中缓冲盐浓度过高起不到清洗的作用，以及溶剂瓶中滋生微生物。对于非循环的溶剂瓶除了定期更换溶剂外还应注意，不要让溶剂瓶中的溶剂跑空。

如果要使用了高浓度盐类流动相（通常大不超过1moL/L），在后密封清洗系统没有充分运行（大于5min）的情况下，严禁运行泵，否则将造成柱塞杆及柱塞密封的损坏。

泵的部件中有peek（聚醚醚酮）材质组件，在使用特殊溶剂时，peek材质的管线或其他部件会发生溶胀现象，建议更换耐受以上溶剂的不锈钢备件或钛或者MP35N等材质的备件。