低压：一般而言，低压适合易分离化合物，但分离时间长很容易造成敏感化合物分解。
中压：中压一般采用恒流泵提供恒定的流动相流速，填料颗粒更小，分辨率更高，耐受更高压力和更快流速。
高压：高压通常在分离制备的后阶段采用，应用于分离困难的样品，纯度甚至能达到99.9%。
与传统的纯化方法（如蒸馏、萃取）比较，制备色谱是一种更有效的分离方法，因此被广泛应用在样品和产品的提取和纯化上。随着合成、植化、生化和制药等领域对高纯度组份的需求不断增加，制备型液相色谱仪应用的领域也在迅速的扩大发展。目前，实验室级别的制备液相色谱主要用于以下领域：
1.天然药物化学、中药化学。
2.蛋白纯化。
3.药物杂质纯化。
4.手性化合物的制备。
