翌圣生物科技(上海)股份有限公 >> 进入商铺
2020/4/24 14:51:02精品推荐|NGS实验小助手,纯化、分选皆全能
进口磁珠用量大,价格高,实验进展不下去?
翊圣DNA纯化分选磁珠,满足您的需求!
DNA///片段纯化与分选是高通量测序中文库制备的必要环节。目前,市面上的AMPure XP磁珠几乎占据半壁江山,但其高昂的价格令许多测序公司感到巨大的压力。翊圣生物匠心研发专为二代测序设计的简单高效、高通量DNA纯化分选精品—Hieff NGSTM DNA Selection Beads,可无缝替代AMPure XP产品,不仅性能优异,而且质优价廉。
产品介绍
基于SPRI(Solid Phase Reversible Immobilization)原理,配合精心优化的缓冲体系,可兼容不同品牌的DNA、RNA建库试剂盒,使用方式相同,片段回收效率和文库大小分布均与AMPure XP Beads高度吻合。主要应用于二
代测序文库构建过程中的DNA///片段分选、纯化。
图1 翊圣磁珠特点
产品亮点
亮点1 精准分选-分选精度
分选精度一般是双轮分选后DNA///片段的分布准确性。目前市场上各厂家磁珠的buffer配方不同,对各个DNA///片段的回收比例也不尽相同。因而评估磁珠的分选精度不适合各品牌平行比较,而应是根据各厂家推荐的比例,完成对应大小的DNA///片段筛选。
通常可通过Agilent 2100检测样本分选后的片段分布。
磁珠分选实验,模式样本,用XP磁珠和翊圣磁珠做平行实验,二者回收效率,片段大小基本一致。
图2 翊圣磁珠不同分选比例峰图
亮点2 高效纯化-回收效率
磁珠回收效率一般是以回收后的DNA总量与初始的投入DNA总量的比值来计算。相同的DNA投入量,回收效率越高越好。但评估各品牌的磁珠回收效率首先要看磁珠回收的片段是否相同,只有在相同的回收效果时比较回收效率才有意义。
通常可通过Qubit定量回收前后的DNA总量计算回收效率。
平行 | 样本 | Input(ng) | 纯化(1.8×) | ||
纯化后(ng) | 回收率% | 平均回收率 | |||
平行1 | A-XP | 169.5 | 153.25 | 90.41% | 90.41% |
B-YS | 159.75 | 94.25% | 94.5% | ||
C-YS | 162 | 95.58% | |||
D-YS | 158.75 | 93.66% | |||
平行2 | A-XP | 156 | 92.04% | 92.04% | |
B-YS | 156.5 | 92.33% | 93.51% | ||
C-YS | 160 | 94.4% | |||
D-YS | 159 | 93.81% |
图3 翊圣磁珠和AMPure XP磁珠回收效率对比
案例展示
实验目的:核酸纯化/分选
实验方案:1.8×(DNA纯化);0.65×/0.2×(DNA分选)
评估指标:纯化/分选后磁珠回收效率
磁珠纯化/分选后条带分布
实验结论:相同样本,DNA打断后初始浓度是13 ng/ul,投入量159 ng,分别用翊圣DNA磁珠与AMPure XP磁珠回收后,平均回收效率分别为104.55%和96.23%。0.65×/0.2×分选后,平均回收率基本一致。
综上可知翊圣DNA磁珠与AMPure XP磁珠回收效率相近,回收效果以及分选效果高度一致。
品牌 | 样本编号 | 1.8X纯化后浓度(ng/μL) | 分选(0.65X/0.2X) | |||
投入量 | 回收量 | 回收率% | 平均回收率 | |||
XP | A1 | 6.40 | 148 ng | 30 ng | 20.27 | 21.28% |
A2 | 31.2 ng | 21.08 | ||||
A3 | 31.8 ng | 21.49 | ||||
A4 | 33 ng | 22.30 | ||||
翊圣 | B1 | 36.3 ng | 24.53 | 22.30% | ||
B2 | 34.5 ng | 23.31 | ||||
B3 | 30.9 ng | 20.88 | ||||
B4 | 30.3 ng | 20.47 |
图4 翊圣磁珠和AMPure XP磁珠分选数据
图5 翊圣磁珠和AMPure XP磁珠分选峰图
综合分析,翊圣磁珠在不同样本的适用性、大小片段的回收效率、分选精度和批次稳定性方面基本相当,但价格方面,翊圣磁珠优势明显,可成为AMPure XP的*。
参数 | Yeasen | AMPure XP |
样本适用性 | ★★★ | ★★★ |
大片段回收效率 | ★★ | ★★★ |
小片段回收效率 | ★★★ | ★★★ |
DNA纯化效率(NGS) | ★★★ | ★★☆ |
批间稳定性 | ★★★ | ★★★ |
价格 | ★ | ★★★ |
分选精度 | —— | —— |
常见FAQ问答:
Q1:产品的原理是什么?
A1:产品是基于SPRI(Solid phase reverse immobilization)原理制备的,其在特定条件下,可选择性吸附不同片段大小的DNA。亲和吸附分选。
Q2:产品的主要应用是什么?
A2:产品主要应用于高通量测序DNA///片段的纯化和分选。对于PCR或者酶切DNA产物的纯化也可以使用,可以有效去除dNTP,引物,引物二聚体,盐离子等杂质。
Q3:产品可以重复使用吗?
A3:产品不可以重复使用,乙醇洗脱步骤将影响磁珠表面活性基团性能。
Q4:与AMPure XP相比,怎么样?
A4:我们的产品制备原材料*进口,可以完美替代AMPure XP Beads。在使用方法,文库大小分布和回收效率上,与AMPure XP Beads*一致,您可以直接按照AMPure XP Beads的操作方式使用,无需摸索条件。
Q5:DNA回收效率低。
A5:可能原因:DNA与磁珠比例不满足分选要求;乙醇浓度低。80%乙醇需现用现配,放置时间过久,可能由于乙醇挥发,造成浓度降低,影响洗脱效果;洗脱溶液体积不足;洗脱溶液孵育时间过短;磁珠过度干燥。
建议:按照分选推荐比例添加磁珠;80%乙醇现用现配;洗脱溶液需*覆盖磁珠;磁珠应于洗脱液中按规定时间孵育,常规为5分钟;切勿室温干燥磁珠大于10分钟,过度干燥将降低洗脱效率。
Q6:纯化后DNA在后续实验中表现不理想。
A6:由乙醇残留引起,可能是操作时磁珠分离时间过短或磁力器磁力较弱,洗脱步骤中吸取上清速度过快等。建议确保在后一步洗涤结束后,溶液中无残留乙醇。磁珠可于室温干燥5-10分钟,使乙醇*干燥。
订购信息
名称 | 货号 | 规格 | 价格 | 优惠价 |
Hieff NGS® DNA Selection Beads(Superior AMPure XP alternative) | 12601ES03/08/56/75 | 1/5/60/450 mL | 296/986/6286/26186 | 192/641/4086/17021 |
原价450ml,26186元 大包装,更优惠 | 1~5瓶,13500/瓶 6~10瓶,12000/瓶 11~20瓶,9800/瓶 21~50瓶,8000/瓶 51~100瓶,7000/瓶 (>100瓶,另议) |
相关产品
类别 | 名称 | 货号 | 规格 | 价格 | 优惠价 |
DNA | Hieff NGS® cfDNA Clean Beads(100~200 bp) | 12599ES03/08/56 | 1/5/60 mL | 466/1666/9106 | 303/1083/5919 |
Hieff NGS® Smarter DNA Clean beads (50 bp以上) | 12600ES03/08/56/75 | 1/5/60/450 mL | 386/1386/7586/29886 | 251/901/4931/19426 | |
RNA | Hieff NGS® RNA Cleaner | 12602ES03/08/56/75 | 1/5/60/450 mL | 366/1066/4266/38566 | 238/693/2773/25068 |
Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit | 12603ES24/96 | 24/96 T | 616/2266 | 400/1473 |
往期精彩回顾
磁珠深度解析,真的非AMPure XP不可吗?
解读NGS建库DNA分选纯化磁珠技术的优势,同样品质,3倍成本之差,你选谁?
精品推荐|DNA建库*磁珠,总有一款适合你