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NGS实验小助手,纯化、分选皆全能

翌圣生物科技(上海)股份有限公 >> 进入商铺

2020/4/24 14:51:02

精品推荐|NGS实验小助手,纯化、分选皆全能

 

进口磁珠用量大,价格高,实验进展不下去?

翊圣DNA纯化分选磁珠,满足您的需求!

                                    

DNA///片段纯化与分选是高通量测序中文库制备的必要环节。目前,市面上的AMPure XP磁珠几乎占据半壁江山,但其高昂的价格令许多测序公司感到巨大的压力。翊圣生物匠心研发专为二代测序设计的简单高效、高通量DNA纯化分选Hieff NGSTM DNA Selection Beads,可无缝替代AMPure XP产品,不仅性能优异,而且质优价廉。

 

产品介绍

基于SPRI(Solid Phase Reversible Immobilization)原理,配合精心优化的缓冲体系,可兼容不同品牌的DNA、RNA建库试剂盒,使用方式相同,片段回收效率和文库大小分布均与AMPure XP Beads高度吻合。主要应用于二

代测序文库构建过程中的DNA///片段分选、纯化。

 

 

图1 翊圣磁珠特点

 

产品亮点

亮点1 精准分选-分选精度

分选精度一般是双轮分选后DNA///片段的分布准确性。目前市场上各厂家磁珠的buffer配方不同,对各个DNA///片段的回收比例也不尽相同。因而评估磁珠的分选精度不适合各品牌平行比较,而应是根据各厂家推荐的比例,完成对应大小的DNA///片段筛选。

通常可通过Agilent 2100检测样本分选后的片段分布。

 

磁珠分选实验,模式样本,用XP磁珠和翊圣磁珠做平行实验,二者回收效率,片段大小基本一致。

 

2 翊圣磁珠不同分选比例峰图

 

亮点2 高效纯化-回收效率

磁珠回收效率一般是以回收后的DNA总量与初始的投入DNA总量的比值来计算。相同的DNA投入量,回收效率越高越好。但评估各品牌的磁珠回收效率首先要看磁珠回收的片段是否相同,只有在相同的回收效果时比较回收效率才有意义。

 

通常可通过Qubit定量回收前后的DNA总量计算回收效率。

 

平行

样本

Input(ng)

纯化(1.8×)

纯化后(ng)

回收率%

平均回收率

平行1

A-XP

169.5

153.25

90.41%

90.41%

B-YS

159.75

94.25%

94.5%

C-YS

162

95.58%

D-YS

158.75

93.66%

平行2

A-XP

156

92.04%

92.04%

B-YS

156.5

92.33%

93.51%

C-YS

160

94.4%

D-YS

159

93.81%

3 翊圣磁珠和AMPure XP磁珠回收效率对比

 

案例展示

 

实验目的:核酸纯化/分选

实验方案:1.8×(DNA纯化);0.65×/0.2×(DNA分选)

评估指标:纯化/分选后磁珠回收效率

          磁珠纯化/分选后条带分布

实验结论相同样本,DNA打断后初始浓度是13 ng/ul,投入量159 ng,分别用翊圣DNA磁珠与AMPure XP磁珠回收后,平均回收效率分别为104.55%和96.23%。0.65×/0.2×分选后,平均回收率基本一致。

综上可知翊圣DNA磁珠与AMPure XP磁珠回收效率相近,回收效果以及分选效果高度一致。

 

品牌

样本编号

1.8X纯化后浓度(ng/μL)

分选(0.65X/0.2X)

投入量

回收量

回收率%

平均回收率

XP

A1

6.40

148 ng

30 ng

20.27

21.28%

A2

31.2 ng

21.08

A3

31.8 ng

21.49

A4

33 ng

22.30

翊圣

B1

36.3 ng

24.53

22.30%

B2

34.5 ng

23.31

B3

30.9 ng

20.88

B4

30.3 ng

20.47

4 翊圣磁珠和AMPure XP磁珠分选数据

 

5 翊圣磁珠和AMPure XP磁珠分选峰图

 

综合分析,翊圣磁珠在不同样本的适用性、大小片段的回收效率、分选精度和批次稳定性方面基本相当,但价格方面,翊圣磁珠优势明显,可成为AMPure XP的*。

 

参数

Yeasen

AMPure XP

样本适用性

★★★

★★★

大片段回收效率

★★

★★★

小片段回收效率

★★★

★★★

DNA纯化效率(NGS)

★★★

★★☆

批间稳定性

★★★

★★★

价格

★★★

分选精度

——

——

 

常见FAQ问答:

Q1:产品的原理是什么?

A1:产品是基于SPRI(Solid phase reverse immobilization)原理制备的,其在特定条件下,可选择性吸附不同片段大小的DNA。亲和吸附分选。

Q2:产品的主要应用是什么?

A2:产品主要应用于高通量测序DNA///片段的纯化和分选。对于PCR或者酶切DNA产物的纯化也可以使用,可以有效去除dNTP,引物,引物二聚体,盐离子等杂质。

Q3:产品可以重复使用吗?

A3:产品不可以重复使用,乙醇洗脱步骤将影响磁珠表面活性基团性能。

Q4:与AMPure XP相比,怎么样?

A4:我们的产品制备原材料*进口,可以完美替代AMPure XP Beads。在使用方法,文库大小分布和回收效率上,与AMPure XP Beads*一致,您可以直接按照AMPure XP Beads的操作方式使用,无需摸索条件。

Q5:DNA回收效率低。

A5:可能原因:DNA与磁珠比例不满足分选要求;乙醇浓度低。80%乙醇需现用现配,放置时间过久,可能由于乙醇挥发,造成浓度降低,影响洗脱效果;洗脱溶液体积不足;洗脱溶液孵育时间过短;磁珠过度干燥。

建议:按照分选推荐比例添加磁珠;80%乙醇现用现配;洗脱溶液需*覆盖磁珠;磁珠应于洗脱液中按规定时间孵育,常规为5分钟;切勿室温干燥磁珠大于10分钟,过度干燥将降低洗脱效率。

Q6:纯化后DNA在后续实验中表现不理想。

A6:由乙醇残留引起,可能是操作时磁珠分离时间过短或磁力器磁力较弱洗脱步骤中吸取上清速度过快建议确保在后一步洗涤结束后,溶液中无残留乙醇。磁珠可于室温干燥5-10分钟,使乙醇*干燥。

 

订购信息

 

名称

货号

规格

价格

优惠价

Hieff NGS® DNA Selection Beads(Superior AMPure XP alternative)

12601ES03/08/56/75

1/5/60/450 mL

296/986/6286/26186

192/641/4086/17021

原价450ml,26186

大包装,更优惠

1~5瓶,13500/瓶

6~10瓶,12000/瓶

11~20瓶,9800/瓶

21~50瓶,8000/瓶

51~100瓶,7000/瓶 (>100瓶,另议

 

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类别

名称

货号

规格

价格

优惠价

DNA

Hieff NGS® cfDNA Clean Beads(100~200 bp)

12599ES03/08/56

1/5/60 mL

466/1666/9106

303/1083/5919

Hieff NGS® Smarter DNA Clean beads (50 bp以上)

12600ES03/08/56/75

1/5/60/450 mL

386/1386/7586/29886

251/901/4931/19426

RNA

Hieff NGS® RNA Cleaner

12602ES03/08/56/75

1/5/60/450 mL

366/1066/4266/38566

238/693/2773/25068

Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit

12603ES24/96

24/96 T

616/2266

400/1473

 

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