分子定向进化模拟自然选择过程，改变原有蛋白的氨基酸序列，以期获得具有功能的突变蛋白。基因突变文库是DNA变体序列的组合，是基因合成、基因突变和定向进化研究相结合的产物。基因突变文库已经越来越多地应用于研究领域，如高通量药物靶点筛选，蛋白质工程定向进化，合成多样性抗体库用来筛选高亲和力和特异性的变异抗体等。
丙氨酸扫描文库（Alanine Scan Library）
通过用丙氨酸逐一取代每一个位置或关键位置的氨基酸，发现对蛋白功能、相互作用和形态具有重要功能的氨基酸残基。
随机突变文库（Randomized mutant libraries）
凭借我们的基因合成技术，能够在合成DNA片段上生成多种形式的随机突变基因，实现可控的随机化。体外文库合成技术能够引入具有可控灵活性的随机突变。
定点饱和突变文库
通过对目的蛋白的编码基因进行改造，对不同位点的氨基酸分别进行19个氨基酸的替换，用于研究筛查功能性氨基酸残基。
应用领域
筛选具有改良性状（高亲和力、特异性）的抗体、配体及受体等；
自然界中现存的生物酶的催化功能或自然界中不存在的生物酶[1]；
DNA疫苗、蛋白表达、基因治疗；
分子定向进化、研究蛋白质结构和功能关系、探讨基因调控机制等[2]。
参考文献
[1] Williams G J, Domann S, Nelson A, et al. Modifying the stereochemistry of an enzyme-catalyzed reaction by directed evolution[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2003, 100(6): 3143-3148.
[2] Wang T W, Zhu H, Ma X Y, et al. Mutant library construction in directed molecular evolution[J]. Molecular biotechnology, 2006, 34(1): 55-68.
