环氧乙烷的杀菌效果受多种因素影响。为了达到更理想的杀菌效果，只有有效控制各种因素，才能充分发挥二手2方环氧乙烷灭菌柜的杀菌效果。影响杀菌效果的主要因素有：浓度、温度、相对湿度、作用时间等。
环氧乙烷浓度是影响二手2方环氧乙烷灭菌柜灭菌质量的重要因素，常用浓度范围为450-1200mg/L；随着温度的升高，环氧乙烷的杀菌作用加强，杀菌温度一般为35℃—60℃；灭菌物品的含水量、微生物的干燥环境和灭菌环境的相对湿度对环氧乙烷的灭菌有显着影响。一般常见的相对湿度为45%-75%；杀菌时间一般为105-300min。这些因素直接影响灭菌的成败。只有四个关键因素平衡，才能保证杀菌质量。
菌体外的包装、装载、杀菌处理和防护用品也影响杀菌效果。包装材料的表面特性和厚度对杀菌效果有影响。应选择易于渗透环氧乙烷且残留量小的材料。因此，在选择消毒或灭菌物品的包装材料时，不仅要考虑包装的美观、轻便、密封性、经济性等因素，还要考虑环氧乙烷气体能否渗透，从而使包装内容符合灭菌要求。
已消毒的物品应*清洁并适当预润湿，消毒清洗是灭菌前不可忽视的重要环节，尤其是可重复使用的物品和设备，需要*清洗和冲洗，去除黏膜或其他有机物。任何残留物质都会阻碍微生物与二手2方环氧乙烷灭菌柜环氧乙烷气体的有效接触，甚至会对细菌产生保护膜，影响杀菌效果。因此，被污染的物品必须用流水仔细清洗，用酶浸泡>5min，然后用环氧乙烷灭菌器消毒。
