细胞实验室根据功能分区可以分为洁净区和非洁净区。
细胞实验室洁净区包含：更衣区;缓冲区;细胞制备区;细胞培养区;配液区;微生物检测区。
细胞实验室非洁净区包含：样本接收区;免疫检测区;细胞生物学检测区;理化检测区;物料存放区;清洗消毒区;气体储存区;信息中心区;细胞储存区;档案存放区。
首洁净室的净高度应在2.5-2.8m之间。总体布局不应交叉混合使用，且应符合人、物分流的原则。人流通道、洁净区入口应设缓冲室。废物、污染物应设置专用传递窗，不应与细胞产品、洁净物品合用一个传递窗。传递窗送风方式应采用上送侧回的方式。通道门的开启方向应由低洁净级向高洁净级的方向开启。所有洁净区不应安装水池和地漏。
洁净区的环境技术指标应符合以下要求：更衣、缓冲、细胞制备区、细胞培养区的空气洁净度应满足C级。温度应控制在22±4℃，湿度应控制在45%～65%为宜;
在通风方面洁净区与非洁净区之间、不同空气洁净度的洁净区之间的压差应>10Pa。洁净区内不同功能及级别房间之间宜保持适当的压差梯度，以防止污染和交叉污染;总送风量中(非单向流)应有10%～30%的新风量。
