洁净室的分类可以从两个主要维度进行划分：一是基于气流流型的分类，二是基于主要控制对象的分类。
首先，从气流流型的角度来看，洁净室可分为以下几类：
1、单向流洁净室：此类洁净室中，空气流动方向单一，通常自洁净室的某一侧流向另一侧，确保空气在流动过程中不产生大的涡流，从而保持室内环境的洁净度。
单向流气流净化利用活塞和挤压原理，将尘埃粒子从一端推至另一端，并用洁净气流替换污染气流。这种净化方式包括垂直和水平两种流型。
垂直单向流是洁净气流自顶部向地面流动，速度是0.25m/s～0.5m/s，能实现高洁净度级别，但投资及运行成本高昂，因此应减少使用面积，仅用于关键部位。
水平单向流则是气流从送风墙流向对面的回风墙，速度是0.3m/s～0.5m/s，可实现100级洁净度。
2、非单向流洁净室：与单向流洁净室不同，非单向流洁净室内的空气流动方向并非单一，可能存在多个流动方向，这种流动模式通常用于对洁净度要求稍低的场所。
非单向流气流的净化原理是稀释原理。一般型式为高效过滤器送风口顶部送风；回风的型式有下部回风、侧下部回风和顶部回风等。用不同送风换气次数，可实现不同的洁净度级别。
3、混合流洁净室：这类洁净室结合了单向流和非单向流的特点，部分区域采用单向流设计，而另一部分则采用非单向流设计，以满足不同区域的洁净度需求。
混合流洁净室的特点是将垂直单向流面积压缩到最小，用大面积非单向流替代大面积单向流以利节省初投资和运行费
4、矢流洁净室：此类洁净室利用特定的气流组织形式，使空气在室内形成特定的流动路径，从而达到高效去除室内污染物的目的。
矢流洁净室的气流以放射型流线形式流出，流线间无竖向交叉，因此能以较少的送风量实现较高的洁净度。这一特点使得矢流洁净室在某些特定的实验室中得到了广泛应用。
5、不同洁净级别洁净厂房的送风量、冷量投资耗电的指标（仅供参考）
其次，从主要控制对象的角度来看，洁净室可分为以下两类：
1、工业洁净室的核心任务是控制灰尘粒子，无论其是否具备生命特征。工业洁净室广泛应用于电子、航天、航空、机械、化工、化学制药、能源、纳米等多个工业领域。特别是微电子和光电子工业，更是离不开洁净室及其相关技术。
2、生物洁净室主要关注有生命的微生物粒子，如病菌、病毒等，这些活的粒子对人类、动物及环境构成潜在威胁。生物洁净室在医疗（如洁净手术室、洁净病房）、生物制药、实验动物饲养、生物安全实验室、食品、化妆品以及卫生防疫检疫等领域得到广泛应用。近年来，生物洁净室的发展迅速，并得到了国家和地方政府的认可与高度重视。
3、工业洁净室与生物洁净室的对比表
综上所述，洁净室的分类可以从气流流型和主要控制对象两个维度进行划分，以满足不同领域和场所对洁净度的需求。
