核酸染料是一种花青素染料,毒性低,使用安全,能有效保护实验操作人员和环境。
1、无毒性。油性大分子特性使其无法穿透细胞膜进入细胞。Ames试验结果也表明,这种染料的致突变性远远低于EB。
2、灵敏度高。适用于各种大小片段的电泳染色,对核酸迁移的影响小。
3、稳定性高:核酸染料适用于用微波或其他加热方法制备琼脂糖凝胶;在室温下的酸或碱缓冲液中极为稳定,耐光性强。
4、信噪比好:样品的荧光信号强,背景信号低,荧光强度是EB的十倍以上,亮度明显强于EB。
5、操作简单。与EB一样,染料在预制凝胶和电泳过程中不会降解;电泳后的染色过程也只需30分钟,无需脱色或洗涤,可直接用紫外凝胶透射仪观察。
6、适用范围广。可以选择电泳前染色(凝胶染色)或电泳后染色(气泡染色);适用于琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶电泳;可用于dsDNA、ssDNA或RNA的染色。
7、核酸染料具有理想的兼容性。具有与EB相同的光谱特性,不需要更换滤光片和观察装置:标准EB滤光片或SYBR滤光片都适用,可以用与EB观察相同的普通紫外凝胶透射仪观察,在300nm紫外光附近可以获得最佳激发。但SuperRed不能*被488nm氩离子激光或类似波长的可见光激发,所以不建议使用此类激发装置的成像系统。