革兰氏染色方法基于某些细菌细胞壁中肽聚糖之间的反应。
革兰氏染色包括给：细菌染色，用染剂固定颜色，使细胞脱色，并进行复染。
①结晶紫与肽聚糖结合，将细胞染成紫色。
革兰氏阳性细胞和革兰氏阴性细胞的细胞壁中都含有肽聚糖，
所以最初，所有细菌都会染成紫色。
②碘和碘化钾用作染色剂或固定剂。
革兰氏阳性细胞形成结晶紫碘复合物。
③用酒精或丙酮使细胞脱色。
革兰氏阴性细菌的细胞壁中的肽聚糖要少得多，因此这一步骤基本上使其无色，
而革兰氏阳性细胞中只有一些颜色被去除，这些细胞含有更多的肽聚糖（细胞壁的60-90%）。
革兰氏阳性细胞的厚细胞壁在脱色步骤中脱水，导致细胞收缩，并将染色碘复合物滞留在细胞内。
4. 脱色步骤后，应用复染（通常是藏红，但有时是紫红色）将细菌染成粉红色。
革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌都会染上粉红色的污渍，但在革兰氏阳菌的深紫色上看不到。
如果正确执行染色程序，革兰氏阳性菌将为紫色，而革兰氏阴性菌将为粉红色。
