拿到显微镜之后，别着急使用，先把工作台擦干净，将要观察的标本和各种器具准备好。显微镜从镜箱取出，取出的时候记住一只手握住镜臂，另外一只手托底座将其轻放；距离工作台边缘8到10厘米左右，偏左一点的位置。显微镜对光，先安上合适的目镜，将10倍、40倍、100倍物镜按照顺时针安在物镜转换器上，逆时针转动转换对准载物台中央的通光孔。从目镜中观察，调节反光镜或接通电源，直至视场明亮。
调节可变光阑，聚光镜的镜口率与物镜的镜口率保持一致，才能充分发挥舞静的分辨率，显微镜调整到工作状态后，从目镜筒中拔出目镜，一边观察，一边缩小光阑，这时可看到缩小的光阑被物镜成的像，然后逐渐调大光阑，当光阑像的边缘与物镜通光孔黑圈的边缘一致时停止，这时的聚光镜镜口率与物镜镜口率就一致了。
标本放置在载物台上，使标本对准通光孔正中，下降镜筒或升高载物台，使物镜下端和标本逐渐接近，但不能碰到盖玻片。从目镜观察，用粗准焦螺旋慢慢升起镜筒，下降载物台，再调节细准焦螺旋至物像清晰。
显微镜低倍镜观察下，找到要进一步观察的部位，移至视野中心，再上升聚光镜、逆时针转动物镜转换器换上高倍镜。显微镜高倍镜观察下看到标本后，把需要进一步放大的部位移至视野中心。上升镜筒或下降载物台约1.5厘米。将物镜转离光轴，在盖玻片所要观察的部位上滴一滴香柏油，把光阑升至最大。换上油镜，小心调节粗准焦螺旋，使油镜慢慢下降或慢慢上升载物台，从侧面观察油镜下端与标本之间的距离，当油镜的下端开始触及油滴时即可停止。调节细准焦螺旋，直至看清标本物像。显微镜使用完毕之后，上升镜筒、下降载物台，将油镜转离光轴，用干的擦鏡纸轻轻地吸掉油镜和盖玻片上的油，如果觉得不干净的话，可用浸湿二甲苯的擦鏡纸擦拭。
