当公司期望为增加产量而使用非均相系统来扩大生产规模时，通常会使用更高的磁力来分离磁珠。所导致的结果是，最靠近磁体的那部分磁珠受到的力非常大。另外，当体积增加时，分离时间也会大大增加，以便在不均匀磁力分布的系统中收集到可接受比例范围内的磁珠。实际上，系统中使用的磁体越大，想要获得与较小生产规格相同或相似的磁珠产量，所耗费的分离时间反而越长。
较长的分离时间再加上暴露于很高的磁力环境中，会导致磁珠不可逆的聚集板结团块增加形成。这个问题会造成产量降低，并迫使操作人员采取一些非常规的重悬方法，例如使用超声处理。为了重悬这些团块而进行的超声处理会增加分离过程的步骤，从而导致生产批次的时间更长，过程中投入的时间和金钱也更多，这就使得整个开发过程所需的时间更长以及需要更多的资源来验证处理。
您可以通过使用足够低的力来尝试避免这些问题，这样就不会随着时间的延长将磁珠暴露于如此高的磁力之下。但是对于使用非均相的磁性分离系统时，要么大大增加磁珠的损耗，要么指数级的延长分离时间。但使用均相磁性分离系统，既可以减小对磁珠的作用力，又可以减少分离时间。这些系统中的分离时间与容器的直径成正比。 由于使用力小且分离时间短，因此在使用均相生物磁分离系统时可以成功避免不可逆的聚集问题。
