毛细管色谱柱可分为空心柱、填充毛细管柱、微填充柱及多孔层空心柱等类型。
1、空心柱
又可分为涂壁空心柱(WCOT)和涂载体空心柱(SCOT)等：
(1)WCOT柱是将固定液涂在经过预处理的毛细管内壁上，现在多数毛细管柱属于这种类型。
(2)SCOT柱是先将载体(多用硅藻土)粘着在厚壁玻璃管内壁上，然后加热拉制成毛细管。载体均匀分布在毛细管的内壁上，再涂上固定液即成SCOT柱。它的柱容量比WCOT高。
空心柱渗透性好，分析速度快。因无涡流扩散项，且传质阻力小，所以柱效*，理论板数可达106.但柱容量低，进样量少，常需采用分流器。[1]
2、填充毛细管柱
将粒状固体如载体、吸附剂(Al203)装入玻璃管中，然后拉制成毛细管，使固体融入毛细管内壁，这样制成的填充毛细管柱既可以作为吸附柱，也可涂上固定液使用。其渗透率介于填充柱和毛细管柱之间，所以填充毛细管柱兼有填充柱和空心柱两者的优点，是较好的一类色谱柱。[1]
3、微填充柱(micro-packedcolumn)
柱内径一般为0.5~1mm。与填充毛细管柱不同，它是先拉成毛细管后、再填入微粒固定相的。对填充物的机械强度、热稳定性要求不高，且填充物可涂任何固定液。由于固定液的用量较少，颗粒间空隙也小，故柱效高，理论板高可达0.3mm。微填充柱的优点是载气线速对柱效影响不大，故可提高载气流速，以进行快速分析；柱效高；试样处理量较大，可以不分流进样。[1]
4、多孔层空心柱(PLOT)
即在空心毛细管内壁上，用适当的方法沉积一层多孔性物质，它可以是吸附剂，也可以是涂固定液的载体。PLOT柱使空心柱的*性得到更充分的发挥。与WCOT柱比较，PLOT柱柱容量大，内表面积大。它综合空心柱和填充毛细管柱的优点，因此有利于高效快速分析。
